1930年，十三岁的林语慧因为是庶出而失去母亲，跟着养母从上海到了南京。为了生计，每日陪着养父沿着秦淮河畔寻觅生计，五年后的偶遇父亲的故友陈默人，被带进新的家庭，与陈沛文兄妹及仆人高伯之孙——高金榜相识，以一个普通女孩的身份继续着忍辱负重的生活。因为父亲林楚沧与陈默人有过指腹为婚之约，她只好将与高金榜的爱情深埋于心，在日寇的铁蹄踏遍南京之时，用孱弱的肩膀挑起了救助难民、保护至死不做汉奸的陈默人的大任。令她未曾想到的是，一直不愿接纳的未婚夫积极走向革命，曾经深爱的人却一步步成为民族的敌人。她在强敌遍布四周的南京，巧设计谋除去民族的敌人；又以民族大义鼓励向自己表达真爱的未婚夫走上更广阔的革命之路。林语慧，一个秦淮河畔的普通女孩，以平凡的歌声唱响了战争年代的南京爱情故事 。

20世纪30年代上海滩，叶飞的父亲魔术世家锦荣班班主叶锦 荣因挑战德国魔术师胜利后被其他魔术班排挤迫害含恨而终，叶飞北上拜在名师门下学成之后回到上海为父报仇。之后得上海黑帮老大之女萧瑶倾慕。抗战爆发，叶飞与黑帮联手截获日军大批军火送给共产党，萧瑶也因保护叶飞身亡。叶飞报仇后逃到重庆参加文艺义演为前线募捐，在一次前线演出时与鬼子遭遇，队长李蓉冒死救出重伤的叶飞，两人组成了家庭。

自十三世纪开始，倭寇为患中国，明朝嘉靖年间贻害最烈。权奸严嵩父子把持朝政，军队无能。日本九州藩招揽武士浪人，勾结海盗大举入侵，略地屠城；中华帝国面临着有史以来最严峻的海权挑战。

丁水妹的哥哥丁大水成亲，结婚船队在白洋淀上和八路军侦察连的船相撞，撞坏了船头象征吉祥的龙王头，丁水妹向连长老魏讨个说法，老魏说自己正在执行重要任务。丁大水喝令丁水妹放八路军走。八路军伏击伊藤大队长押送的船队，日军仓皇逃窜，八路军的船小拦不住日军的汽船，丁水妹跳入水中，用渔网绊住螺旋桨，拦截了一艘货船。

1937年，抗日战争爆发。南京守城军官的石永凯在南京保卫战中结识了中国共产党地下党员袁玉婷、大学教授周永民、国军士兵许秀岚、帮派首领林万龙、民间手艺人陈熹年、爱国富商彭松祥等人，他们团结一致，成功保护大部分幸存的南京市民和朝天宫国宝。