反黑组警长警长肥沙，不慎丢失手枪。这件事非同小可，如果手枪被匪徒用去行凶，肥沙将大祸临头。PTU警官何文展出于义气，答应一定会在天亮之前寻回手枪，带几名手下开展了寻枪行动。另一方面，却在横生枝节：警员Kat死守纪律，坚持要将此事汇报上级处理；而在同一晚，CID的Madam张在接手一单黑社会谋杀案时，怀疑肥沙与黑社会有染，由此与PTU发生意见分歧。人与人，部门与部门之间的矛盾、争斗和角力，在夜幕中徐徐拉开。而第二天清早，揭晓的真相，原来都在他们的意料之外…

黄文展“狗头”（任达华 饰）和何家宝“猪女”（徐子珊 饰）是香港CIB（Criminal Intelligence Bureau）的职员。CIB俗称香港警察中的狗仔队，里面人人行动低调样貌平凡，但却对罪犯有极其灵敏的嗅觉。 狗头和猪女这次的任务是追踪珠宝劫案的疑犯陈重山（梁家辉 饰）。陈重山是个犯案“天才”，对躲避警察追捕有丰富经验和巧妙手段。这次CIB行动，比平时都更为艰巨。尽管已经警方十面埋伏，狗头和猪女都使出浑身解数，陈重山还是屡屡逃脱。一路的跟踪就好像猫捉老鼠，没完没了。陈重山似乎有神奇的力量，闻到警察追到身边的气味。眼看有警员在追踪过程中殉职，狗头和猪女心急如焚。

隶属西九龙机动部队B连的展执行职务时，殴打了一名叫大麻成的积犯，警察投诉课对此事进行内部调查。为了亡羊补牢，展等人必须先投诉科一步找到大麻成。展那队中还有一警员孖八，负资产导致他欠债累累，更因此即时调到文职的岗位。孖八在PTU的最后一个更份，碰到大麻成与另一疑一疑犯贩毒。孖八虽成功拘捕疑犯，但他深感自己被警队出卖，他没有到枪房交枪，意欲用自己的枪来为自己讨回公道。这时，展得悉孖八的想法，他既要面对