《匠匠匠》的故事开始是由一个对世界充满好奇、喜欢思考、尤其是对周围各色各样的物件感兴趣的小男孩小松开始的。一天小松意外发现花园里的匠匠小人，原来在一个破旧的工具箱里隐藏着一个秘密工厂，叫匠匠匠工厂，那里每天都在制造各种各样的物件。小松答应保守秘密，通过“彩虹隧道”穿越到一个色彩缤纷的按钮工厂面前！软糖是蹦蹦床，铅笔是滑滑梯，酸奶是白云，吸管是传送带……这里是一个万物的世界！在这里，制造就是快乐的源泉。小松有太多太多的制造问题了！匠匠们决定和小松一起制造吧！匠匠工厂能解答你所有的问题！

大唐武周年间，武后举办了一场盛大的秋猎，邀请王公贵族和擅长武艺的能人共聚一堂、切磋骑射。连山堂传人裴坤作为滕王府的门客，和郡主李莹一起参加了这场盛会。然而庆祝仪式上却突然杀出刺客行刺武后，万幸羽林卫戒备森严，刺杀并未成功，但裴坤的旧相识——吐谷浑小可汗慕容纪竟阴差阳错成了头号“嫌疑人”。裴坤发现刺杀的手法和春秋道十分相似，于是主动入局调查，希望能帮慕容纪洗清冤屈，并抓住幕后黑手。两人一边躲避金吾卫大将军薛小宝的追捕，一边调查线索……