邪恶天才科学家地狱博士企图征服世界，人类因此而陷入灭亡危机，在驾驶魔神Z的兜甲儿以及其他伙伴们的努力下，世界得以恢复和平。十年后，兜甲儿不再是超级机器人的驾驶员，而是成为了一名科学家。某日，他在富士山地底见到了被埋在山底的超巨大遗迹——INFINITY无限魔神，以及同时出现的神秘生命体“莉莎”。而在同一时刻，地狱博士突然神秘地复活了，他还打算利用INFINITY无限魔神所潜藏的无限可能性，完成他征服世界的野心……就在这千钧一发之际，传说中的驾驶员兜甲儿与魔神Z再次挺身而出拯救人类…

传说中的黄金大盗乌南，带着大批黄金隐居到某座岛屿，之后生死不明，向着伟大航道持续前进的的路飞一行人，遇到了梦想成为乌南的部下的少年托比欧，他因为不愿继承爷爷经营的甜不辣摊，和爷爷闹的很不愉快，而爱黄金成痴的海贼艾拉德哥也正窥视著乌南埋藏的黄金……

横滨市未来区的港区，一直延续著历代光之美少女在此地初次联手，打败谜之敌人“融合”的佳话。憧憬著光之美少女的市民们，无一不为这个话题而兴奋；但对刚刚转校、没有朋友的坂上步来说，她无法融入大家一起分享这份喜悦。就在这时，步在学校附近遇上了神秘生物“融融”，两人很快变得十分要好。然而，融融其实是“融合”的黑暗碎片，为了孤独的步，他决定吸收步一切美丽的事物，进而毁灭城镇！为了传递步真正的想法，28位光之美少女再次集结大家的力量，闪耀奇迹之光！