擎天柱、热浪、巨石、追踪和刀锋相继通过扫描获得了恐龙形态，在一次次救援行动中逐渐学会了控制并使用这种新的形态。同时在这一季中，擎天柱把老战友海潮请来，对救援汽车人进行海上救援的训练。之后不久，又有新的塞柏坦伙伴——打捞和啰嗦加入到救援队列中来，他们之间又会碰撞出怎样的火花呢？

变形金刚系列动画主要讲述的是在遥远的宇宙中有一个星球--Cybertron.星球上有一种金属生命体，他们在近百万年间分化成正义的博派--汽车人和邪恶的狂派--霸天虎。两军进行了几百万年的战争，星球能源耗尽霸天虎追随汽车人来到了地球。飞船坠毁在一座火山中。四百万年后，火山爆发飞船的主计算机——显像1号启动，并按飞机和汽车的形态改造两军。战争在地球上展开，到了2000年，汽车人与霸天虎展开血战。...

变形金刚系列动画主要讲述的是在遥远的宇宙中有一个星球--Cybertron.星球上有一种金属生命体，他们在近百万年间分化成正义的博派--汽车人和邪恶的狂派--霸天虎。两军进行了几百万年的战争，星球能源耗尽霸天虎追随汽车人来到了地球。飞船坠毁在一座火山中。四百万年后，火山爆发飞船的主计算机——显像1号启动，并按飞机和汽车的形态改造两军。战争在地球上展开，到了2000年，汽车人与霸天虎展开血战。汽车人

辛桑靠雷麦斯人幕后支持，在罗慕伦发动了政变，并要求星际联邦派企业号前往罗慕伦进行和谈，企业号的皮卡德舰长到达目的地后发现这是一场针对联邦的阴谋，而辛桑则是皮卡德的复制人。皮卡德舰长随即率领船员展开了激烈的反抗，最后在贝森谷附近获得罗慕伦军方的支持并摧毁辛桑的战舰，在这场战斗中，智能机器人戴达为了摧毁菲拉伦辐射发生器，救出皮卡德舰长，与该战舰同归于尽。

皮卡特舰长获知百科中尉在巴库星球被掳为人质后，立刻率企业号前往营救。当他们来到巴库星球，整个星球上只居住了六百名巴库人，与世隔绝、摒弃科技、崇尚和平，过着纯朴的生活。百科被掳不像是巴库人的作风，想必另有隐情。皮卡特舰长遇到一名叫做安妮的巴库女子，经由她得知巴库人虽然看起来年轻，星球的原居民巴库其实年龄都已经超过三百岁了。面临老化的索纳人，发现巴库人长生不老的秘诀在于巴库星球外围的特殊放射线能不断地重组基因结构，如今巴库人要遭受灭种的威胁……来自外层空间的索纳人联结星际联盟，根据原有的巴库人村落拟造了一个一模一样的环境，预谋将巴库人迁徙到这个虚拟村落，企图独享青春泉源。