当年在努布拉岛营建侏罗纪公园时，约翰·哈蒙德曾把附近的索纳岛作为恐龙的制造工厂。侏罗纪公园沦陷后，索纳岛上的恐龙在完全隔绝且缺少必要合成元素的情况下生存了4年时间。哈蒙德对此颇感好奇，他重新找到马科姆博士，邀请他前往小岛考察。4年前经历让马科姆心有余悸，他断然拒绝哈蒙德的提议，但当得知女友莎拉已前往小岛之时，只得跟随探险队整装出发。在索纳岛上，另一组野蛮的探险队已经先期到达，他们抓捕恐龙将其买到外国。利欲熏心使得这些贪婪之徒全然不顾危险，竟然打起暴龙的主意。索纳岛旋即变成恐怖的屠杀地狱。

辛桑靠雷麦斯人幕后支持，在罗慕伦发动了政变，并要求星际联邦派企业号前往罗慕伦进行和谈，企业号的皮卡德舰长到达目的地后发现这是一场针对联邦的阴谋，而辛桑则是皮卡德的复制人。皮卡德舰长随即率领船员展开了激烈的反抗，最后在贝森谷附近获得罗慕伦军方的支持并摧毁辛桑的战舰，在这场战斗中，智能机器人戴达为了摧毁菲拉伦辐射发生器，救出皮卡德舰长，与该战舰同归于尽。