故事发生在2707年，地球的资本已经耗损殆尽，4个由甲士率领的政府——国会、包豪斯、三岛和帝国——瓜分着世界的统治权，策动着连缀不竭的战斗。 米奇亨特是附属于国会政党的士兵，在一次步履中，他无意中破损了一枚古代石头封印，恐怖的仇敌被释放出来，那是如僵尸一般全身腐臭的邪恶突变怪物。这群数目达百万的突变怪物让已经破败不胜的地球雪上加霜。率领者甚至筹算抛却地球独自逃命，弃无数无辜的人们于失踪臂。 从突变怪物的袭击下虎口余生的亨特，碰见了“兄弟会”的首级头子萨缪尔，后者拥有一本古代书籍纪年史。书中预言到突变生物的呈现，以及将有一群人“传递者”将最终杀绝它们。亨特插手了萨缪尔的队伍，一行人冒险潜入漆黑世界的中心拯救世界。他们不单要匹敌多量的悍贼，同时还要面临不死的突变怪物的袭击…… 变异纪年史是一部典型的蒸汽朋克片子。

Susan McAlester博士的试验有望使医学取得重大突破，但她要想使mako鲨的基因重组,却又违反了道德规则。在她的研究中，一种自然界最致命的杀人机器起到了重要的作用，但其本身也变得更加智慧和强大。 然而让McAlester烦恼的并不仅仅是这一致命的生物。她的这种不可靠的研究方式使她和工作组其他成员，特别是鲨鱼专家Carter Blake的关系变得紧张起来。此外，试验船的投资者也疑心重重，威胁要在Susan McAlester博士的一轮主要试验开始前夕关闭所有近海设备。这个试验的主要支持者，Russell Franklin，被派到船上向他们发出最后通牒——研究必须得出确定的结论，否则基金将被撤消。 Susan和她的工作组成功地从最大的mako鲨中提取了脑组织。但是在试验过程中一个不幸的事故引起了一系列的后果，对设备造成无法挽回的破坏。一场大风暴席卷了正在下沉的试验船，科学家和工人发现他们又卷入一场人鲨大战中，而敌人正是他们试图研制的致命的人造生物。