电影主角是第三代蓝甲虫、墨西哥裔美国人海梅·雷耶斯。他生活在德州，捡到了一只蓝色圣甲虫，将其移植到自己的脊椎里，成为拥有外形盔甲、可以随意创造武器的超级英雄。蓝甲虫可以飞行，拥有增强的力量和耐力，能够翻译外星语言。

里昂在执行从绑匪手中解救安东尼奥·泰勒博士的任务时，一个神秘女人挡住了他的任务。与此同时，克里斯正在调查旧金山爆发的僵尸事件，感染原因无法确定，唯一确定的是受害者最近都去过恶魔岛，根据这一线索，克里斯与他的团队前往这座小岛调查，那里有未知的恐怖在等待着他们。

果冻武术学院里是一个和谐的地方，果冻们在里面快乐地学习、玩耍。不料有一天来了一个不速之客，他就是四大恶贼之一的贼眉鼠眼，扰乱了学院里的安宁。方丈为了维护和平，把夜燕以及上官子怡、梨花诗、花如意赶到天山上，希望她们成为果宝女特攻。而自己则把挚情之剑卖给了陆小果，赤霄剑不得已送给了菠萝吹雪，像菜刀的圣道剑送给了橙留香，因而有陆小果的一句“名言”：“果然是武功再高，也怕菜刀”。果宝特攻们听说大魔头东方求败和四大恶贼残害村民，就下决心要为民除害。不料这是跑龙套小果叮的诡计：他先给七色彩莲下了三种最毒的毒——孔雀石绿、苏丹红、三聚氰胺。然后派一些水果村民到处散布谣言，说东方求败创立的水果加工厂，是水果们的地狱，好让他们斗个两败俱伤。后来，一场官司证明了东方求败以及四大恶贼是清白的。小果叮设计捉住了果元天尊的五个驾驶者，并且驾驶着果元天尊跳上了花果山第七层。花果山第七层可不是人人都可以上去的地方，它是一个倒立的三角形，只要别人在上面召唤果宝机甲，花果山第七层就会倒塌。以小果叮为首的跑龙套们和以橙留香为首的果宝特攻们在第七层召唤了果宝机甲，就使第七层变得非常不稳定。魔霸天王为了水果世界，为了支撑花果山第七层，为了给果宝特攻争取时间，不惜一切代价，抽干了火山能源，最后还启动了生命之源。而第七层又是一场激烈的战争。果宝特攻们见合体不行，就分体进攻对手。一开始占了上风，可是后来梨花诗和菠萝小薇不幸被抓住，被踩死，陆小果和花如意也因为双剑合璧进攻失败而被偷袭而死，上官子怡为了救橙留香而牺牲，菠萝吹雪也因为偷袭失败而死。最后一个橙留香为了水果世界而开启生命之源，使用了正气乾坤炮，最终也牺牲了。

西岭草根少年宁弈拥有特殊的饕餮体质，与身负血仇的裴烦相依为命，后又因异宝骨笛和神秘少女徐清焰有了羁绊，蜀山剑仙徐藏教授宁弈剑道至臻，骨笛又助他成就执剑者之尊，背负拯救天下苍生与光明的责任。

冰河历二五零一年，魔族与兽族生存的小行星飞至，撞击法蓝星唯一的大陆——妖精大陆，史称大灾变。人类先祖天行以《预言之书》预言大灾变一事后，妖、精两族大能联合所有种族共同炼制神器七神珠，对抗撞击，避免世界的毁灭。妖精大陆随之四分五裂，化为七海六域。大灾变三百多年后，魔族逐渐苏醒，并向七海六域伸出了自己的爪牙……两位人类少年在机缘巧合之下，获得了七神珠中的无双珠，令他们拥有可以相互召唤的能力。而人类的命运，也即将改写！