该剧以中国工程院院士、我国爆炸力学和核试验工程领域的著名专家林俊德院士的事迹为原型，真实讲述了他74年朴素的人生和生命最后八天壮举的故事，同时也展示了为国防事业无私奉献、隐姓埋名、鲜为人知的一个群体可歌可泣可敬的人生。林俊德是福建永春大山深处一个地道农民寡妇的后生，1955年十七岁考上大学，靠乡亲们20元的接济走进了大学的浙江大学。1960年在中华民族危难之时，林俊德以优异的成绩毕业，并被急招入伍，成为一名核国防战线上年轻的战士，上哈军工、改专业、担任全国最年轻的科研组长……从此他与中国的核试验和国防科技研究结下了不解之缘，其“生命不息，冲锋不止”的科技人生，正式拉开了帷幕！

正值中年的刘立成（张嘉译 饰）是某大学社会学教授，在外他是学识渊博，谈吐潇洒的婚姻问题专家，人们都将他的讲座光盘奉为圭臬，然而回到家中的刘立成却有着难以道尽的苦衷。刘的妻子孙晓丹（朱媛媛 饰）美丽干练，独当一面，但是洁癖的毛病可真真害苦了劳工刘立成。加上从结婚起就和公婆住在一起，心高气傲的晓丹自然有着诸多愤懑与不平，于是乎她和丈夫的争吵不断，矛盾也逐渐升级，最终闹到了离婚的地步。

末代皇帝溥仪仓皇离开紫禁城并遗弃“国宝”御马——汗血宝马。原兵部大臣索望驿欲将宝马送回天山大草原，以赎当年血洗天山马场夺马之罪。扮作大镖师布无缝的草原英雄套爷从草原来到京城，企图利用落难王爷曲宝蟠除掉索望驿，并利用宫中太监洪无常盗回汗血宝马，不料误中圈套，壮烈献身。 　　宫廷乐手赵细烛受索望驿以死相托，救护汗血马逃离皇宫。一心想要复辟并坐上龙椅的麻大帅派出三路人马追夺汗血马；美女艺人鬼手则扮...

故事开始于圆明园。深夜，一宫女在一太医掩护下，偷袭了雍正的寝宫…… 雍正暴死，人头丢了。下葬时用一颗金头代替。 乾隆继位，立即多方秘密追查刺杀雍正之人。几番搜查之后，雍正时期文字狱的最大冤主吕留良家族的唯一活口吕四娘被认为正是割走雍正人头之人。(吕四娘从文字狱案逃脱后被江湖上大名鼎鼎的独臂神尼收为徒弟习武，长大后本事甚为了得。)乾隆严命“雍正无头案”不得走漏半点风声，并秘命内廷四大侍卫南下追捕吕四娘。其中领头者为一等侍卫伊尔根。 吕四娘其时正和太医曹太虚奔走在南方的某个小城里，行医卖艺。雍正晚年崇尚金石之术时，曹太虚原是皇上身边的方士之一。 乾隆对此案志在必得，又派特使快马加鞭传旨到南少林，要南少林派人暗中密查吕四娘和曹太虚下落，追回雍正的人头。特使找到南少林的老主持玄通大师，将皇上御赐的龙牌交与他，凭龙牌行事，不得有误。 此时南少林寺内正在热火朝天准备一次三十六房主持的竞选，这次竞选意义非同一般：谁当上三十六房主持，就成为南少林武功第一，也就是半个中国武功第一。寺内上下都明白最有实力者非方世玉与云明二人莫属。 特使提议谁最后成为胜出者，谁就可持龙牌抓人。但玄通明白按照比武规则，世玉和云明进入最终对决必有一死一伤，而且也延误圣命。玄通断然宣布，二人比试南拳七十二式点到为止，谁胜出谁就能凭着龙牌去执行朝廷交给的任务。云明自知武功稍逊世玉，本想在最后的比试中做手脚陷害世玉，以夺得主持之位。面临突然的变动，他顺水推舟，干脆在比试中败在世玉手下。他更想趁此机会，在世玉追查吕四娘行踪的途中杀死世玉，并栽赃给吕四娘。这样他可稳当坐上三十六房主持之位。 方世玉邀请两位老朋友——“江湖老千”卓灵和“神偷”赵大宏(在第一部中本说到大宏已死，但世玉等人发现棺木里是空的，大宏死而复生。疑是三德和尚营救了大宏)一起踏上征程。世玉的恩师、三十六房的创始人三德和尚早已被逐出南少林，得知世玉接受朝廷指派任务出行的消息后，悄悄跟随世玉一行，暗中相助。 泉州知府温荣玉绰号“玉老虎”，与云明勾结，欲在途中加害方世玉。原来他与云明都知晓世玉身上的一个秘密，那便是刺在他背上的一张“藏宝图”。明朝正德年间，倭寇在南少林寺后山埋下了一批珍宝，价值连城。悉知此事的三德和尚将藏宝的地图刻在世玉的后背上，没有留下任何副本。所以杀了世玉，云明可得主持之位，玉老虎可拿着人皮地图起获珍宝。一举两得的事情，唯有联手胜算最大！ 云明和玉老虎想从世玉身边的亲密朋友下手，于是设计欲买通卓灵和赵大宏。卓灵和赵大宏知道了宝藏图，却瞒着对此事不知内情的世玉，打起了自己的算盘：好东西干吗不自己留着？ 另一方面，三德和尚此次跟随世玉的主要目的也是为了保护宝藏图不落人他人之手——其实他并非真正被逐出少林，而是由玄通大师暗中安排在寺外接应南少林，并保护这批珍宝。 世玉一路乔装打扮，和卓灵、赵

自清雍正以来，乐家老店同仁堂被钦定为“御药供奉”，至乐家第八代已声名大震。病家闻名纷纷求药，而日本浪人小野勾结在乐家长大的曹化伦，蓄谋夺走密方药谱。甲午战争，清军赴朝鲜抗敌。乐宏达赶造出十万包“诸葛行军散”，赠送将士，却被药材商人借机抬价，欠下巨款。年关债主逼债，乐宏达借贷无门，愤而变卖祖宅。药材商人得知赠药原因，慨然放弃债权。老店又一次绝处逢生。老店在废墟上重张，乐宏达却因饱受摧残离别人世。弥留之际，正值他的儿子乐同仁满岁“抓阄”。在满桌的官帽、元宝、笔墨、绸缎之间，小同仁却抓起了《同仁堂药典》。