以东京为中心发生了6起连环杀人案件。除目暮警部外，还有各县刑警和小五郎参加了调查会议。令柯南意想不到的是，他发现一位会议上的刑警进入了一辆跑车里。“那辆车……难道是，琴酒的？”“黑衣组织”中的一人潜入了调查会议，并乘琴酒的车逃走了。连续杀人案件是“黑衣组织”搞的鬼吗？危机一触即发！如果让琴酒知道工藤新一还活着的话，不仅会危及新一，还有柯南身边的人。意识到事情危险性的柯南独自开始调查。

曾隶属于W国的精锐私人保镖韩彬，在保护小女孩Sherry一家时任务失败，全家惨遭杀害，父亲研究的高科技生物技术胶囊丢失。从此销声匿迹，颓废终日。老拍档希望他重新振作并带来新任务，保护H国女团全球巡演。一路不断收到死亡威胁，韩彬披荆斩棘危险过关，锁定最终嫌疑人首富养女——安吉。原来首富正是当年对Sherry一家出手的幕后真凶，策划这一些列恐怖事件的真正目的不是女团，而是韩彬！是为了给当年死在韩彬手中的儿子复仇。冷血无情的嫌疑人安吉竟然是当初的小女孩Sherry……

夏白橙参加大学面试时，因为过于紧张差一点摔下楼梯，正好撞到下层的石井学长。夏白橙感觉怦然心动，当下决定要将追求石井作为自己大学生活的新篇章。随后赶到并看到这一幕的发小胡理山为自己没能先石井一步而懊恼不已。夏白橙为了能跟石井一同上课，努力读书。有天夏白橙无意间在图书馆的角落发现一本不知是谁留下的日记，这本日记成为夏白橙追逐石井的恋爱指南，她便拉着胡理山做军师。胡理山假意答应帮忙，实则计划着见招拆招，令夏白橙能注意到自己。不久，夏白橙陷入退学危机，她在艰难险阻中逐渐成长，也发觉自己对石井只是崇拜会之情。当三人认清自己内心后，共同携手为学校荣耀而奋战。

顺治年间，牛大宝一心想与心上人袁玉娥建立家庭，在追求过程中阴差阳错成为了京师总驿站皇华驿一员，而袁玉娥是洪帮的成员。为了保护心上人袁玉娥，牛大宝凭着智慧取得驿长龙定海信任，暗中为化解洪帮与清廷的矛盾做出努力。在一系列的事件中，他一边保护与自己误结连理的善良青楼女子春花，一边运用他的智谋破坏了皇华驿的一系列阴谋，除掉了罪恶深重阴险狡诈的茅罡、一口鸟等密探。经历一番风雨洗礼后，牛大宝终于从一个普通的市井小民成长为有智谋、有胆略、有正义感的义士，通过他的努力，让老百姓避免了一场战乱之苦……

终于有一天，人类向血族和狼族宣战，这两个族群遭到大肆围剿与屠杀。塞琳娜和约翰也在这场浩劫中遭难，当她再次醒来时，却发现自己被名为抗原研究所的机构囚禁起来，编号实验品1号。她奋力突破了束缚，根据共视的能力在黑暗的都市中寻找实验品2号—约翰。途中她遭遇血族的同伴相助以及狼人的袭击，当她找到被狼人们追逐的实验品2号时却发现，眼前竟是一个从没见过面但有着极为恐怖力量的小女孩—伊薇