闭塞的闽北山村长生村中，三房家长董兆如却被一条浮出河面的蟒蛇拖入河中吞食。族长董兆吉认为被长生村所崇拜的“长蛇仙”现身了，可能因为这十年族人没给长蛇仙献祭惹恼了巨蟒，一场血雨腥风在所难免……董兆吉遣人掳走没有家长也没有靠山的二房少女董文娟，要选择良辰吉日将其推入河中献祭给巨蟒，保山村平安。哥哥董文林为了救出妹妹，决心一定要赶在祭祀之前找到罪魁祸首巨蟒。

百万富翁王百万（周星驰 饰）被人用冰锥插死，由于他与妻子汤茱蒂（梅艳芳 饰）的感情破裂，汤茱蒂便有最大的嫌疑。刚好周星星（周星驰 饰）的相貌与王百万几乎一模一样，警方便让周星星假扮王百万让汤茱蒂带回家，好让周星星能够从中寻找证据。当周星星进入王家后，发觉王百万的好友林大岳（黄秋生 饰）也有重大嫌疑。怎料林大岳也同样被杀害。案情疑点重重，周星星后来发现汤茱蒂跟王百万的女秘书有暧昧的关系。

故事讲述了杨家父女、张三链子等一行人，在军阀阎立本的胁迫下踏入神农架密林。在森林中先后遭遇各种生物攻击，危难之际众人被野人营救。阎立本因贪念最终被巨蜥杀死，野人为了保护神农架奋勇搏斗，最终几人合力将巨蜥击杀，深林和村落再次回归平静。

周星星（周星驰 饰）是飞虎队队长，奉命以卧底的身份到圣育强中学寻找警司于参观时被窃的配枪。周星星就算百般无奈还是接受了任务。他很快适应了学校的生活，功夫高强的他也受到了学校众多学生的拥戴，周星星也顺势调查失枪案件。警队的另一位卧底曹达华（吴孟达 饰）也参与了这个案件，最后也与同学一起合力，帮助周星星破获一踪大型军火贩卖案件。

影片讲述了黑瞎子为营救旧时战友，深入柬埔寨密林古迹，在古迹地宫深处力战隐藏其中的奇虫异怪，并解开战友失踪之谜的冒险之旅。