巧虎因妈妈忙于照顾小花妹妹闹起了小脾气，在与小伙伴们排解心事时 偶遇来自绿森林王国的小发明家松鼠金金。 绿森林因长时间缺雨，居民生存环境面临威胁。金金向巧虎及小伙伴们发出邀 请，一同前往绿森林设计制作大飞船，采集云彩人工降雨。 巧虎和小伙伴们相互协作，凭借顽强的毅力及现场观众的加油鼓励下，克服了 种种困难最终取得成功。 经历冒险后成长的巧虎理解到了妈妈的不易，并对妈妈大声说出了自己的爱。

在这部全新的系列电影中，巧虎和小伙伴们追着一个叫做小镜的神秘少年来到传说中生长着七色康乃馨的魔法岛，为得到能够实现美好心愿的七色康乃馨送给妈妈，也为了帮助小镜完成心中的愿望，巧虎、小镜和他的小伙伴们在岛上开始了一段刺激有趣又新奇温暖的冒险之旅。

故事围绕着巧虎和家人、朋友在生活里遇到的各种情况展开,巧虎和他的小伙伴们一起完成各种挑战，体验亲情、友情、团结合作的力量，教导孩子们遇到困难时要想办法解决并勇敢与人交流。在生活中与人和睦相处、感恩家人并且爱护大自然。让孩子们在快乐的观看动画的同时，收获更多正面的教育，让小朋友们和巧虎共同趣味探索，学习思考，不知不觉中成长进步。

故事围绕着巧虎和家人、朋友在生活里遇到的各种情况展开,巧虎和他的小伙伴们一起完成各种挑战，体验亲情、友情、团结合作的力量，教导孩子们遇到困难时要想办法解决并勇敢与人交流。在生活中与人和睦相处、感恩家人并且爱护大自然。让孩子们在快乐的观看动画的同时，收获更多正面的教育，让小朋友们和巧虎共同趣味探索，学习思考，不知不觉中成长进步。

《可爱巧虎岛第六季》描写巧虎在“巧虎岛”的生活，在如梦的世界的冒险或跟家族和朋友的纠纷的故事。