- 在早已逝去的江户时代，武士阶层中有一个特殊的群体，他们就是专为将军或者藩主准备料理的菜刀武士，虽然无法上阵杀敌，但手中的菜刀确实丝毫不亚于武士刀的重要存在。加贺藩首屈一指料理人舟木传内年事已高，原本作为继承人的长子突然病逝，而次子安信专爱舞刀弄剑，厨艺却令人不敢恭维。在藩内一次盛大的宴会上，藩主侧室阿贞夫人身旁一个貌不惊人的侍女，却凭借着出色的味觉和对料理的才学感悟令传内所钦佩。在此之后，传内再三恳请，终于让名叫小春的侍女同意嫁给安信为妻。小春过门后，通过一场料理对决令丈夫甘心随她学习厨艺。安信在妻子的辅导下，渐渐成为足以独当一面的合格包丁侍。可就在此时，一场血腥风暴向加贺藩袭来……
- 故事发生在东京八丈岛近海，这里建成了一座连接了全球各地警方监控摄像的海洋设施“太平洋浮标”。在这座设施正式启动之前，为了与欧洲刑警组织管辖的范围联网，世界各国的IT工程师来到现场。而与此同时，一项应用了人脸识别系统的“新技术”的测试也在进行中。另一方面，柯南和少年侦探团在园子的招待下来到八丈岛赏鲸。此时，柯南接到来自冲矢昂（赤井秀一 配音）的电话，被告知欧洲刑警组织的成员在德国遭到琴酒的杀害。为调查真相，柯南偷偷混进了前往“太平洋浮标”进行警备工作的黑田兵卫等警视厅人员乘坐的警备艇中，进入设施内部。之后，在为系统启动而稳步展开准备工作的设施内，发生了案件——一名女性工程遭到黑衣组织的绑架，而她手中装有某些情报的U盘也落到了黑衣组织的手里。
- 为了守护世界，不惜拼上性命的男子——门田广见，回到了自己的故乡。在上次与欧鲁特加的激烈战斗中，刚刚辞去菲尼克斯司令官一职的广见，受伤坠落悬崖，下落不明。大家都以为他已经凶多吉少，但广见奇迹般地生还了。因为菲尼克斯的欺骗，广见心灰意冷，身体状况也不容乐观，他独自回到了老家。身处绝望深渊的广见，将何去何从？是什么样的地方，孕育出了这样一切极富正义感的青年？而广见敬爱的母亲又是怎样的人物？一切答案都将在本作中揭晓。 广见面对上门来找他的一辉等人，假装自己失去了记忆。但当他打算向母亲说明所有事情真相的时候，母亲倒下了。广见知道了一个惊人的消息…养育他长大成人的母亲和父亲，真实身份到底是什么？如今，广见即将“复活”，母亲、故乡、还有幼年的回忆，一切都让广见变得更加强大，重新回到大家身边。
