这个家庭有着一对父母、十二个孩子和一堆宠物，热闹混乱的局面反而为家庭增添快乐。尤其是那些性格不一、年龄各异的儿女们，就像活宝一样深得父母欢喜。现在，这家人正面临着前所未有的变化：因为父亲汤姆（史蒂夫·马丁 Steve Martin 饰）要去大城市的高校球队任教，他们要搬往那里生活了，这亦意味着，孩子们会有更好的教育和更广阔的发展空间；当然，父母日渐繁忙的工作也会削减他们和孩子沟通的时间。 母亲凯特（邦尼·亨特 Bonnie Hunt 饰）的作家事业也如日中天，甚至要离家宣传新书。孩子们已经和父母日渐生疏，大城市的生活让这个家庭得到了日渐光鲜的地位，却失去了内在的情感纽带。看来，汤姆和凯特要重新思考和抉择了。

本季是由几个有趣的小故事组成的，具体是指在这个疯狂的动物城中，观众们所熟知或曾在电影中未被引起重视的大小人物的背景故事以及曾经错综发生在电影之中那些大小事件背后的不为人知的小故事。其中有一个故事就是讲，当初那个被朱迪救下的老鼠大佬家的女儿的事。那天，在她被朱迪从大甜甜圈底下救出前后的时间段里，她到底发生了什么事情呢？原来，在本季中讲述了她办婚礼前，因为要从所有要好的亲戚朋友中选定自己的伴娘，反而和曾经因为误会而失联很久的儿时好友再次有了联系，有些事情是除了当事人，外人永远无法理解的，这恰巧是她们之间那又爱又恨的永不磨灭的闺蜜之间的小故事；既然有婚礼前的小故事，那一定少不了婚礼上发生的事情咯。婚礼上，老鼠大佬将家族移民振兴的故事也娓娓道来，让观众们进一步了解了，小小的老鼠家族是如何在动物城里深得民心后而振兴的，也讲述了与追随他多年的北极熊家族之间的真挚感情和感人的过往。还有一位是观众们都非常熟悉又自带搞笑特质人物的小故事，那就是慢性子闪电在他飙车被朱迪拦下之前，他到底发生了什么呢？一个出乎意料的关于闪电的故事，随即带给喜爱他的观众们。

故事发生在一个所有哺乳类动物和谐共存的美好世界中，兔子朱迪（金妮弗·古德温 Ginnifer Goodwin 配音）从小就梦想着能够成为一名惩恶扬善的刑警，凭借着智慧和努力，朱迪成功的从警校中毕业进入了疯狂动物城警察局，殊不知这里是大型肉食类动物的领地，作为第一只，也是唯一的小型食草类动物，朱迪会遇到怎样的故事呢？ 近日里，城中接连发生动物失踪案件，就在全部警员都致力于调查案件真相之时，朱迪却被局长（伊德瑞斯·艾尔巴 Idris Elba 配音）发配成为了一名无足轻重的交警。某日，正在执勤的兔子遇见了名为尼克（杰森·贝特曼 Jason Bateman 配音）的狐狸，两人不打不相识，之后又误打误撞的接受了寻找失踪的水獭先生的任务，如果不能在两天之内找到水獭先生，朱迪就必须自愿离开警局。朱迪找到了尼克，两人联手揭露了一个隐藏在疯狂动物城之中的惊天秘密。

开发出新能源的迈尔斯伯爵召开世界杯赛车大奖赛，各路好手纷纷云集，独独缺了活塞杯霸主闪电麦昆（黄磊 配音）。原来他刚好回到温泉镇，与好哥们板牙（范伟 配音）、女友莎莉享受快乐的假期。由于意大利方程式赛车法拉斯·高的挑衅，当然也有吃醋的原因，麦昆最终同意参加世界杯，并带着板牙等好友一同周游世界。在日本站比赛的前一天，板牙偶然结识了英国特工迈克飞弹和霍莉（姚晨 配音），他们正在追查一支犯罪团伙的新动向。板牙阴差阳错被霍莉当作美国来的街头特工，由此卷入了麻烦之中。在次日的比赛中，麦昆与法拉斯·高竞争激烈，与此同时不断有选手意外爆缸，板牙则撞见迈克和神秘组织火并的场面。 因这一连串意外，麦昆和板牙的友情受到动摇，而这一切的幕后老版也渐渐露出真实面目……

1935年。5年。美国南部惨淡肃杀的冷山监狱。这里有片一英里长的绿地，人们叫它“绿里”。不过，它的居民皆为死囚，在绿地的另一头，便是行刑用的电椅。保罗.艾治科姆（汤姆.汉克斯饰）是这里的狱监，对于走过“绿里”、继而在电椅上惨叫毙命的死囚行刑程序，他俨然已无动于衷。除了保罗及其爱妻简外，“绿里”上还有凶残的副狱监豪威尔，有施虐倾向的狱吏佩西，良心未泯的看守海尔和他身患绝症的妻子美琳达，喜用宠物鼠逗狱吏和诸“难友”取乐的德拉克，连环杀人狂威廉，负疚深重的犯人彼特等一干形形色色的人们。他们之间充满了敌意和不屑。但神秘的约翰.考夫利的到来改变了一切。考夫利因谋杀两名幼女被判死罪，他相貌恐怖，体形硕大，却出奇地平和、敏感而缄默，天真时甚至像个孩子，同时，他似乎还具有一种不可名状的神秘力量，令人不由自主地对其产生信任感，这不禁让艾治科姆对其罪行是否属实深怀疑问。 真情无法取代程式，考夫利终要走过“绿里”。在这个貌似粗鲁的男人即将赴死的刹那，“绿里”上的人们以不同以往的形式实现了各自生命的重要跨越。