在感情的旋涡中，肖太平几乎也无法自拔。他与花船上的风尘女子玉倩儿邂逅，陷入了难分难解的情感纠葛。令他更为难堪的，他把梦寐以求有朝一日再举义旗的理想寄托在子嗣身上，可老天赐他的却偏偏是个女儿。春秋又是几度，清政府办起了官窑。英国人也竖起了洋井。肖太平更是陷人了内外交困的绝境。屋漏又逢连夜雨。他相知相爱的玉倩儿又在花船的恩怨斗争中遭人暗算而香消玉殒。肖太平过度悲恸得昏迷不醒，随之须眉皆白。这时，肖太平的女儿肖洋从海外留学归来，参加了风起云涌的秘密斗争，而出人意料的，英国洋井的买办，竟是曹二顺的儿子曹杰克。他们又一次走上了风雨的生命旅程。肖洋被与洋人官府勾结的曹杰克告密捕走。久卧病床的肖太平神奇地苏醒过来。他与搭救过肖洋的曹二顺重新站到了一起。两个老兄弟黯然无语，握手言和，对着后人，取出窑银，勉励他们踏着肖洋的足迹继续前进。

公元1884年，中法战争爆发，法国侵略者在中国的藩属国越南挑起事端，大举进攻中国驻军，援越桂军遭受北宁惨败。法国向中国提出巨额赔款要求，因目的未曾达到，恼羞成怒，派中将孤拔率领远军舰队开赴中国，企图占领台湾港口，迫使清政府屈服就范。 战报传到京城，朝廷震怒，清议沸腾，战和两派争执不下。面对危难局势，刚刚掌握朝廷实权的慈禧决心与法军开战。于是急招归隐已久的淮军大将刘铭传回京，临危受命，以巡抚衔督办台湾军务，担负起保台抗法的重担。此事遭到湘军老帅左宗棠的强烈反对，认为刘铭传好大喜功，品行不端，不可委以重任。刘铭传几经周折，终于得到朝廷信任，总算得以成行。 为了打击清政府，在谈判桌上获得优势，法军准备截杀刘铭传。刘铭传得知此事，以谈判副使的身份来到上海。又故意出入青楼妓院，迷惑法国人。经过巧妙周旋，终于有了机会，即将成行。不料，援越淮军在越南观音桥打了胜仗，慈禧突然变卦，命刘铭传继续留在上海参与谈判。更让人忧虑的是，台湾兵备道刘璈担心刘铭传抵台后自己地位不保，纵容其子刘浤将刘铭传收养太平天国护王之女刘淑婷一事透露给朝臣。满朝为之哗然。 法方的无理要求再次激怒慈禧，用人之际，有意庇护刘铭传，便勒令刘铭传尽快赴台。而此时孤拔已经封锁海面，刘铭传一时进退两难。无奈之下，刘铭传接受了日本人的帮助，乘商船驶往台湾。 刘铭传抵台后，立即整顿军务，积极备战。然而，台湾战备松懈已久，一旦交火恐怕不堪一击。再加刘璈父子对刘铭传恨之入骨，湘、淮两系将官矛盾重重。面对众多棘手问题，刘铭传凭着自己的智慧和魄力逐一解决。 1884年8月4日，法军统帅孤拔向中国基隆驻军送来“劝降书”，被严词拒绝后，发动首次进攻，轰炸了基隆炮台。面对敌强我弱，刘铭传沉着应战，传令部队撤出阵地，诱敌深入。法军不知是计，登陆后拼命抢占制高点。清军趁机伏兵四起，将法军打得惨败。孤拔一怒之下炸毁了福建马尾船厂，打破了马尾、基隆互成犄角之势。随后孤拔又封封锁台湾。 当法军卷土重来之时，刘铭传考虑到沪尾的战略位置十分重要，毅然决定令人炸毁基隆煤矿，使法国兵舰得不到煤的补给。又采纳李彤恩的建议，主动撤出基隆，全力保住沪尾。因为沪尾一旦失守则台北危机，若台北沦陷则台湾不保。他的撤基保沪这一决定，却不被大多数人理解。湘系将领孙开华等人激烈反对，自己的淮系将领曹国忠等人跪地哭谏。刘璈父子为使事态恶化，煽动不明真相的番民滋扰闹事。但刘铭传毫不动摇，喝令“有不遵令者斩”。他明明知道大清律里有“失地失城者斩”的律令，为了战略决策，却不得不强行为之。 两军交火，法军轻易占领基隆，却发现基隆已是一座空城。战舰得不到足够的补给，无法长期作战，孤拔不得不强攻沪尾。刘铭传在沪尾再次大胜法军。孤拔不甘失败，率舰队北上攻击定海。激战中，孤拔本人也中弹负伤，不久，在澎湖郁郁而死。中法战争就此结束。 在请功奏折名单中，

从宫中逃亡出来的宫女王宁氏，带着襁褓中的女儿流落民间。20年后，女儿柳如是长成一位绝色才女。一次偶然的机会，她与赫赫有名的文坛领袖钱谦益在秦淮河畔邂逅了，二人由敬慕彼此的才华而心生爱意。在经过无助而无奈的时空等待、感情试探和生活考验之后，二人终于互明心迹并终成眷属 　　然而一场大的时代变革到来了，宛如一场风暴把两人脆弱的爱情推向危机四伏的边缘。清朝摄政王多尔衮率八旗劲旅兵临南京城下，南明王朝君臣四散，留下钱谦益独撑危局。钱谦益为全城百姓免受涂炭，将南京城拱手相让。 　　多尔衮入城以后，将柳如是软禁在软香阁里劝她归顺。柳如是靠智慧和胆识使多尔衮甘拜下风，使多尔衮意识到，仅仅靠武力是不能使天下一统的。

自清雍正以来，乐家老店同仁堂被钦定为“御药供奉”，至乐家第八代已声名大震。病家闻名纷纷求药，而日本浪人小野勾结在乐家长大的曹化伦，蓄谋夺走密方药谱。甲午战争，清军赴朝鲜抗敌。乐宏达赶造出十万包“诸葛行军散”，赠送将士，却被药材商人借机抬价，欠下巨款。年关债主逼债，乐宏达借贷无门，愤而变卖祖宅。药材商人得知赠药原因，慨然放弃债权。老店又一次绝处逢生。老店在废墟上重张，乐宏达却因饱受摧残离别人世。弥留之际，正值他的儿子乐同仁满岁“抓阄”。在满桌的官帽、元宝、笔墨、绸缎之间，小同仁却抓起了《同仁堂药典》。

留洋归来的十三格格如一股清新的风吹进了长久以来阴郁沉闷，禁卫森严的朝廷，她一身西洋打扮觐见慈禧，深得慈禧喜爱，但却引来朝臣们的非议，一时间诸如如倭仁等守旧的王公大臣对这位打扮装束有伤风化，行为举止有失体面的格格指指点点，非议四起，并由此引出一连串啼笑皆非，洋相百出的故事。