该片讲述了ICAC首席调查主任陆志廉与总调查主任程德明发现一起涉及人口贩卖的海关贪腐大案，多名海关高层领导均牵涉其中的故事。

二十年前一宗手术，令两名儿科专科实习医生況丛昕与许甘枫决裂。 时日过去，況丛昕当上顶尖医院“安妮医院”的小儿外科顾问医生，而一心捍卫生命的许甘枫却于一间二线医院落脚，两人本来各走各路，岂料因一宗肝移植手术而再次碰头，命运亦从此连上。況丛昕施计逼令许甘枫加入安妮医院，再找上昔日战友心胸肺外科医生章以芯、外科主管麦海琪打造出一支完美团队，目的只为拼凑心中蓝图，为兴建香港第一所“儿科中心”铺路。 经历一个个病童的生死故事，令原本势成水火的況丛昕与许甘枫逐渐解开心结。

　　数日内，三起“微笑杀人案”震动全城。调查过程中，青年警探、警局“活宝”王不二语出惊人：这是一起连环谋杀案！遂与搭档黄非红开始了一段惊悚刺激，同时又状况不断的“缉凶”之旅。黄非红在旁边看似总是乌龙，但其实是真正的功夫高手，每到关键时刻，他总能帮助王不二化险为夷。案件侦办过程中，王不二先是将怀疑对像锁定为女明星刘金水，随着案情的深入，刘金水的嫌疑被逐渐撇清，她的姐姐戴依依等人又成了王不二的...

苏丝是李痴琛的全职粉丝，苏丝为了对付李痴琛多年来的对手郑恩仪与单恋自己已久的围村邮差何金水一起使尽了各种丑化行为，干尽了疯狂之事。

2004年4月1日，西九龙重案重组沙展冯志伟，卧底探员杨启东、刑事情报科(CIB)高级督察黄家辉，三个本来各不相干的人，于4月1日开始至4月30日内，要捣破香港最大的黑帮集团，更要阻止一项暗杀候任警务处处长王振扬的大阴谋。三人就在这三十日内，将香港作为一个困兽斗的大舞台，用最接近事实的角度，与匪帮作最斗智斗力的竞赛，演绎一个争分夺秒的三十集警察故事。香港副警务处长王振扬一向疾恶如仇，有消息传出扬将会接任成为新一任的警务处长，振扬的上任虽令匪徒闻风丧胆，但亦传出职业杀手已接到命令要置振扬于死地。警方觉事态严重，派出情报科A队高级督察黄家辉全力保护振扬，并令家辉查出幕后黑手的真正身份。家辉经过详细分析后认定是香港最大黑帮家族侯家所为。侯家话事人侯文华更胆大妄为，誓言要在4月30日之前，将香港的黑道拨乱反正，将白道陷于恐慌之中。 文华前往泰国与泰国新崛起黑帮头目Sam商量合作大计，港泰两地黑帮意欲结盟，将整个东南亚的毒品市场垄断，两地黑帮结盟后势力必更大。此举引起了泰国警方的注意，派遣女刑警Rita，接手处理调查。Rita调查Sam，发觉原来Sam只是一个幌子，真正操控黑帮的人竟是泰国华侨富商郑坤，亦是郑坤在幕后一手策划整个行动。 志伟在酒吧认识一名女子彭慧，彭慧更对志伟情有独中，但志伟知悉彭慧原来是文华最深爱女人后，即多番逃避，不过彭慧仍是苦缠不休。文华得悉情敌出现，遂因利乘便插赃嫁祸，令志伟蒙上不白之冤。志伟因杀警之嫌被通缉，心知自己被警察部内奸插赃嫁祸，志伟找家辉帮忙，希望借助情报科搜集出证据查出内奸的真正身份。 家辉从Rita方面得知耀国早派出卧底渗入侯家搜集罪证，于是决定接手调查，并希望卧底能助自己一臂之力。 一波未平一波又起，志伟虽替自己找出辩护证据，但爱女冯美茵却遭文华囚禁，要挟志伟烧毁重案组证物房，偷取一份三十年前的证供。过程中，志伟却发现这一份重要资料，揭示文华与三十年前香港一名大毒枭陈万豪似有着一段不寻常的关系。 志伟与文华终弄至势不两立地步，加上压力越大反抗越大，志伟与彭慧经过风风雨雨，感情反而更趋真挚牢固，一段三角感情令这场正邪对垒更形激烈凶险。振扬康复后准备上任之际，却传来丑闻，指振扬当年涉及一宗受贿枉法案，此事引来极大回响，振扬也有被拉下马来之虞。 万豪重临香江，誓要建立一个前所未有的跨国黑社会王国，誓要香港黑白两道低头。面对这个庞大的阴谋，志伟能否对付文华，与彭慧又能否跨过重重困难，终成眷属？启东为救Rita而燃起爱火，咏琪会否因爱成恨，置其于死地？家辉在仅余的有生之日，能否破「谋杀准一哥」案，与志伟拨乱反正，成功瓦解万豪与文华的阴谋，剿灭这国夸国的黑社会王国？