故事发生在军阀割据时期的鹤灵城，商行少爷肖蓦然不幸被卷入一起凶杀案，在寻求真相途中结识了实为狐族后裔的护城官白祈，并无意中发现了阴阳师晋川的阴谋。也遇到自己心上人——司令之女陈小君，晋川的侍徒禁姬的暗中作祟，对蓦然痛下毒手逼迫白祈出手相救，肖家养子肖其晟因故妒恨肖父，与军阀陈司令勾结，杀害肖父嫁祸肖蓦然。晋川设下圈套，盗得秘宝，法力大增的晋川欲降服白祁获取灵狐圣子与紫印神石的下落。鹤灵城生死存亡悬于瞬间。

奥利维亚·威廉姆斯饰演艾米丽·伯顿·西尔克，霍华德的妻子，一位神秘的女性，是首季故事的中心；哈里·劳埃德饰演彼得·奎尔，是霍华德所在机构的局长，他仔细地规划自己的职业生涯，但同时也身陷间谍世界和双重生活之中。乌尔里希·汤姆森将饰演契诃夫，霍华德所在机构的行动部门主管，同时混和了哲学家和间谍的双重身份。 纳扎宁·博尼亚迪饰演克莱尔，一个有神秘起源的年轻女子，她是驱动该季剧情发展的关键。尼古拉斯·平诺克饰演伊恩·肖，一名工作积极的操作员兼监视者，负责确保两个维度之间的平静。萨拉·塞雷奥科饰演鲍德温，一个神秘的刺客，当她暴露在另一边世界时，她便又了新的计划。

故事发生在军阀割据时期的鹤灵城，商行少爷肖蓦然不幸被卷入一起凶杀案，在寻求真相途中结识了实为狐族后裔的护城官白祈，并无意中发现了阴阳师晋川的阴谋。也遇到自己心上人——司令之女陈小君，晋川的侍徒禁姬的暗中作祟，对蓦然痛下毒手逼迫白祈出手相救，肖家养子肖其晟因故妒恨肖父，与军阀陈司令勾结，杀害肖父嫁祸肖蓦然。晋川设下圈套，盗得秘宝，法力大增的晋川欲降服白祁获取灵狐圣子与紫印神石的下落。鹤灵城生死存亡悬于瞬间。

严锦发觉自己对颜知夏的感情，苦恼不知如何表白；此时因怕女儿身被揭穿，颜知夏想要离开的心情愈加迫切。察觉颜知夏的心情，严锦不忍，决意趁上元佳节送颜知夏离开。临别时，两人确定心意。而此时颜知夏身份被人发现，严锦为了保全颜知夏忍痛将她推向林晏清，自己决定娶将军之女龚止月。颜知夏虽气愤却推测严锦必定是有事相瞒，假意与林晏清成婚骗严锦现身。虽知是圈套，严锦却忍不住现身相见，两个有情人终于直面自己的感情决定与命运抗争。此时颜知夏身份彻底曝光，被全城搜捕；而因严锦出走，各方势力蠢蠢欲动。颜知夏、严锦二人联手寻到严锦生母，得知了严锦身世的真相。在各方势力的支持下二人稳定局面，恢复颜知夏的身份，有情人终成眷属。

十一仓停业整顿期间，吴邪与白昊天一起勇闯死当区，并找到了王俊义，吴邪也终于得知了三叔当年失踪的真相，并发现只有雷城才能解开谜团。众人历经重重难关，最终到达雷城。吴邪发现了雷城里的听雷装置和三叔的最终自白。