女法医聂宝言（陈慧珊）上集黯然与督察曾家原（林保怡）分手后离港，终因姐聂宝意（陈美琪）结婚而返港并复职。宝言、家言二人重遇，但因宝言看穿小棠（李珊珊）对家原仍未忘情，遂有所保留。 　　小棠为成全二人，假意和宝言下属杨志伦（刘恺威）扮作情侣，宝言、家原终复合。 另一方面，聂津津（钟丽淇）因觉曾家乔（鲁文杰）性格不合而提出分手，性格不合而提出分手，辗转与男模特儿袁天明（海俊杰）展开恋情，家乔无奈之余，迁怒袁天明妹妹袁天晴（陈采岚），二人终日斗法，成斗气冤家。 　　宝言、家原合力侦破不少案件，感情更见一日千里。当二人得悉小棠和志伦只是伪装时，决定撮合她与有为律师王英杰（蔡子健），却不知令她堕入了死亡陷阱。

清嘉庆十五年，上承康、雍、干三代盛世丰绩，再加恶吏和珅已诛，朝野内外一片升平景象。然而，皇帝的后宫中，千百年来，仍是一片了无休止的争斗光景，比诸于政坛上男人们的角逐，更见动魄惊心，血肉模糊。 此间，六宫之首虽为皇后钮钴禄氏，但得宠当道者，实为另一钮钴禄氏如妃。时值三年一届选秀入宫，秀女玉莹为贵族之后，姿色过人，遂成为同届佳丽针对对象。另有秀女尔淳，实乃内务

战争年代，时局动荡，人民颠沛流离。 三对不同背景的主人公被卷入硝烟与战火，与挚爱分离。国军军官雷义方（黄晓明 饰）生死不明，太太（宋慧乔 饰）独在台湾饱受相思之苦；军医严泽坤（金城武 饰）与青梅竹马的日本女孩雅子（长泽雅美 饰）因政局变化被分隔，再难相见；底层女性于真（章子怡 饰）和通信兵（佟大为 饰）萍水相逢，又被乱世冲散；尽管命途颠簸，但他们仍不惜与命运奋力抗争，书写了战乱年代的悲欢离合。最终，命运的齿轮将所有人卷入逃难的太平轮上，他们会如何相遇，各自的命运又将何去何从？

1945年夏，国军将军雷义方（黄晓明 饰）在平原战场率兵大败日军。国军通讯兵佟大庆（佟大为 饰）俘获了台湾籍日军军医严泽坤（金城武 饰）。日军投降之后，三人各行其道。雷义方回到了上海，认识了豪门千金周蕴芬（宋慧乔 饰）。两人一见钟情，不久成婚。但随即，内战爆发了。 严泽坤在抗战后回到台湾，却发现曾经的恋人日本女孩雅子（长泽雅美 饰）已经被遣返回日本。佟大庆则爱上了白天做护士照顾伤兵，晚上在街头招客的妓女于真（章子怡 饰），两人原本各取所需照了张“结婚照”，没想到真的成了一对苦恋的情侣。 国共一场大战，国民党军全面溃败。众人都想登上太平轮，离开上海去台湾。这艘船成了最后的希望。没想到，意外的沉船改变了所有人的命运，船上近千人绝大多数都在海难中遇难，几位主角能逃过劫难吗？

李子勇Thomas出生贫穷，年轻时为赚取母亲的医药费拼命打工赚钱，与同在茶餐厅打工的少女方小薇Sammy相识，自此两人变成好朋友。茶餐厅老板分配Thomas到比利时进行走私名表的生意，因一个重大的错误Thomas在比利时留了二十年，他借此结识了出生入死的红颜知己Judy。四年前，Thomas返回香港跟Sammy一起开办餐厅，他重遇在比利时结交的朋友何乐儿Joyce，二人一拍即合很快便走在一起。Thomas后来发现Joyce与胡启源亦已拍拖八年，自己也与一名人妻梁淑媛Catherine育成子，六人关系扑朔迷离。命运让他们的人生交错，相遇 ，相识，相处，相分到重遇，纠缠一辈子的爱恨，换来一声叹息。