在一个相当闭塞的星球上，一个神秘的信号与星星遥相呼应，这吸引了宇宙中最致命的物种都在此集结，这其中就包括博士。在从一个家庭圣诞晚宴上救出克拉拉后，时间领主和他最好的朋友要一起探究这个神秘的信号对他自己以及整个宇宙的命运意味着什么。

随着彼得·卡帕尔蒂成为掌管蓝色盒子的第十二任博士，全新的神秘博士重生了，他开始控制时间机器。博士也必须适应他重生后的新特征和新性格，博士的朋友们也需要时间来适应这位新博士与众不同的风格。神秘的杀手开始在这座都市中秘密行动，一家屠宰场餐馆和一艘被掩埋的宇宙飞船将博士引向一个久违的敌人。在这一季中，博士和他的朋友克莱拉进行了很多奇幻的旅程，他们在试图拯救一艘载着人类幸存者的搁浅飞船时见到了一支戴立克舰队；他们还需要应对在地球上秘密行动的赛博人；他们在和杀手机器人打斗时回到了罗宾汉时代……博士和他的朋友们在时间、空间中探索悠游，打击邪恶力量，拯救文明，帮助不同种族的生物，纠正一些重大的错误，解决五花八门的时空问题。

圣诞节的时候，博士与克拉拉再次相遇。他们与圣诞老人联手援助在北极的一个科学小组，他们正受到梦蟹的袭击。这种生物会紧紧抓住人类的头部，并在吞食人类大脑的同时诱发梦境。但在这种状态下，是否有人能真的相信他们从这一刻到下一刻所经历的一切。

1892年的平安夜，飘落的雪花是童话故事中的元素。当童话变成了一场噩梦，地球面临着令人毛骨悚然的威胁时，一个非传统的年轻家庭教师克拉拉向博士求助。但博士正处于悲痛之中，与世隔绝，并决心不参与宇宙的问题。随着老朋友们的归来，博士是会真的抛弃人类，还是会为了从这个神秘威胁的冰冷魔爪中拯救世界和圣诞节而战。

在这一季中，博士和克莱拉利用时光机在各个不同空间的探险，他们继续闯荡时空，解决各种问题！从最初，博士的宿敌戴沃斯则用计谋将博士，克莱拉和密西带到了斯卡洛星上。博士和戴沃斯正面较量，最终，博士识别了戴沃斯的诡计，并击败了他之后他们来到一个水下基地，在这里，他们又碰到了几个鬼魂以及基地的几名船员，聪明的博士最终击败这些鬼魂，拯救了这些船员。为了击败泥沼怪，阿希尔达失去了生命。博士的善良使他用永生的力量救了阿希尔达，但阿希尔达对博士却也有最初的崇敬，到憎恨，再到反对。之后博士和克莱拉经历了赛冈星人入侵以及最终的臣服、能让人不用休息的墨菲斯睡眠机、以及克莱拉的死亡，而最终，博士将回到伽里弗雷身边，他将和时间领主对抗，拯救克莱拉！