金轮国王妃表哥欧阳锋有染，为霸占江山，他们毒死了国王，但没找到传国玉玺。得知玉玺在前往九宫山找寻其师父求助的三公主手里后，欧阳锋企图抢到手但没成功。糊涂国师在淫威下屈服，查出三公主的具体下落，欧阳锋乘火箭金靴追赶，却误脱落一只插死刚出关的王重阳，奄奄一息的王重阳恳求适逢路过的三公主找到其师弟周伯通代为报仇。逃到九宫山的三公主邀得师弟黄药师与师妹相助，再加上前来寻找表妹的洪七、找到真心人才能成仙的段智兴，一场与欧阳锋的生死恶战蓄势待发……

白莲教徒接下满清大臣纳兰元述所下的对付革命党人的命令后，在广州街头借“扶清灭洋”的口号大肆捣乱洋人的使馆、教堂等地盘，甚至连小学生也不放过，他们的举动令黄飞鸿、十三姨与梁宽异常气愤。 在某个医学会议上，黄飞鸿与革命党领袖孙文一见如故，发现革命党人对救国更具远见时，他决定帮助革命党人逃过厄运。随后，他直捣白莲教总坛决胜九宫真人，揭开迷信假像，又因奋慨国运衰竭民智末开，不惜与纳兰元述决一死战。

社会动荡不安的唐朝未年，每18年举行一次的武林赏善罚恶大会上，武林十大前辈选出移花宫主为担任赶杀十大恶人重任的武侠义士，不料却遭到突至的宫主夫君燕南天的阻止。宫主以一招之差落败燕南天后夫妻反目，立誓18年后将授一门人杀尽十恶。为感谢燕南天的救命之恩，十大恶人担起扶养其儿子小鱼儿的重任，并欲把他培养成天下最恶之人。宫主则收养了花无缺，边授其武功边灌输男人都该杀的思想。18年过去，十大恶人与宫主分别命小鱼儿与花无缺在新一届赏善罚恶大会上争夺盟主，两人的生活轨迹开始交叉。

令狐冲在按计划与日月神教的朋友会面后，将和小师妹岳灵珊等其他华山派师兄弟赴牛背山归隐退出江湖。路途中意外发现练就“葵花宝典”的东方不败，但令狐冲不认识东方不败，误将对方当成一位美貌女子。后来几次相遇，还一道饮酒吟诗。在同任盈盈、蓝凤凰会合后，几个月来江湖不平，大事连连。任我行为东方不败所囚禁，他们商量着夺回日月神教，便乔装进入浪人营打探，救出任我行。另一边华山派弟子惨遭毒手，黑木崖上，令狐冲和一干人都想着报仇，他惊觉眼前人竟是东方不败……

被犬神附身的陈家少主陈奇和他的家臣夜神，趁机来到看守禁地，准备偷取侍魂瓶。犬神借司徒然对他的信任偷取其手印，而后利用忍符和司徒然的手印终于让侍魂瓶现身。另一边司徒然从千姬夫人的歌曲中醒过神来，发现犬神附身的陈奇不见了，赶忙出来寻找，惊觉自己对陈奇情愫更浓。蚀月之夜，犬神设法将侍魂瓶调换，被司徒然识破。司徒然用结界困住犬神，同时怨魔设法让司徒然用驱魔箭射伤犬神。犬神以为司徒然和怨魔相互串通，两人之间误会越来越深。大战结束，犬神为了不拖累陈奇，思来想去最终让司徒然将它收服到侍魂瓶内。最后司徒然带着侍魂瓶，和陈奇夜神结伴去了金陵……