欢迎来到动物汽车岛！岛上栖息着种类繁多的的动物汽车：火炬狗、公牛推土机、弗兰克象、米特龟、米格鹰 ...... 每辆动物汽车的性格各异，并且都有自己的特殊技能，在危急的时刻发挥关键作用。乔尼是一位保护动物汽车岛的小英雄，每当动物汽车们遇到困难的时候，他总会带着最好的小伙伴火炬狗一起进行惊险的救援。大家快来加入乔尼特工队吧，一场精彩的冒险营救即将开启！

在一所动物园里有一家非正常动物研究中心，负责人是动物心理治疗师王医生。他既是疯子也是天才的兽医，他性格古怪，对动物一举一动有一套逻辑自洽的分析和理解。在他的理论和实践下，人类有了真正意义上的第一次和动物真正交流内心世界的机会。优秀的医学毕业生李严在导师王教授的推荐下，成为了王医生的助手，开启了实习之旅。李严并不愿意成为兽医，但王教授此举的真正目的，是让李严查清王医生充满谜题的人生经历。如此这般，天才王医生和菜鸟李严历经形形色色跟动物有关的荒诞故事。最终李严意识到，动物其实并没有问题，真正需要调整思想和人生方向的其实是动物的主人。他俩成为了默契的搭档，治愈动物和主人的方法也得到了越来越多人的认可

导游事业屡屡不顺的光头强偶然捡回丢失的缩小手电筒，为吸引游客，光头强灵机一动，造了一个微观乐园。正当光头强带着缩小后的两熊去体验微观乐园时，突遇暴风雨，缩小手电筒丢失了！为恢复原样，三人开始寻找手电筒，辗转昆虫世界“不夜城”和人类小镇。而另一边，昆虫反派特靠谱得知缩小手电筒的秘密，企图夺取手电筒妄图统治昆虫世界和人类世界！熊强三人在奇特的“微观世界”会有什么奇遇？他们能否成功阻止特靠谱？不夜城将会面临怎样的危机和艰险？导游事业屡屡不顺的光头强偶然捡回丢失的缩小手电筒，为吸引游客，光头强灵机一动，造了一个微观乐园。正当光头强带着缩小后的两熊去体验微观乐园时，突遇暴风雨，缩小手电筒丢失了！为恢复原样，三人开始寻找手电筒，辗转昆虫世界“不夜城”和人类小镇。而另一边，昆虫反派特靠谱得知缩小手电筒的秘密，企图夺取手电筒妄图统治昆虫世界和人类世界！熊强三人在奇特的“微观世界”会有什么奇遇？他们能否成功阻止特靠谱？不夜城将会面临怎样的危机和艰险？

灰太狼遇袭受伤，昏迷不醒。小羊们利用神奇发明，进入充满未知的脑世界，穿梭在一个个光怪陆离的区域中去修复他的大脑危机。在奇幻的冒险途中，小羊们结识了有趣各异的好朋友，大家一起拯救灰太狼。谁知，一切都是狼族的圈套，狼族正在酝酿着惊天的阴谋……

本季是由几个有趣的小故事组成的，具体是指在这个疯狂的动物城中，观众们所熟知或曾在电影中未被引起重视的大小人物的背景故事以及曾经错综发生在电影之中那些大小事件背后的不为人知的小故事。其中有一个故事就是讲，当初那个被朱迪救下的老鼠大佬家的女儿的事。那天，在她被朱迪从大甜甜圈底下救出前后的时间段里，她到底发生了什么事情呢？原来，在本季中讲述了她办婚礼前，因为要从所有要好的亲戚朋友中选定自己的伴娘，反而和曾经因为误会而失联很久的儿时好友再次有了联系，有些事情是除了当事人，外人永远无法理解的，这恰巧是她们之间那又爱又恨的永不磨灭的闺蜜之间的小故事；既然有婚礼前的小故事，那一定少不了婚礼上发生的事情咯。婚礼上，老鼠大佬将家族移民振兴的故事也娓娓道来，让观众们进一步了解了，小小的老鼠家族是如何在动物城里深得民心后而振兴的，也讲述了与追随他多年的北极熊家族之间的真挚感情和感人的过往。还有一位是观众们都非常熟悉又自带搞笑特质人物的小故事，那就是慢性子闪电在他飙车被朱迪拦下之前，他到底发生了什么呢？一个出乎意料的关于闪电的故事，随即带给喜爱他的观众们。