一晃十年过去，地球人和虫族的战争如火如荼，愈演愈烈。某日，空军元帅奥玛•阿诺克（斯蒂芬•霍根 Stephen Hogan 饰）来地球人的远方农场罗库山视察，时任上校的强尼•瑞克（加斯帕•范•迪恩 Casper Van Dien 饰）也一同前来。在此期间，阿诺克的心智被虫王操控，他切断了隔离区的电力，使基地完全失去保护。是夜，虫族对隔离区发动总攻，地球军虽顽强抵抗，终因寡不敌众而告败，基地陷落。阿诺克则和一干心腹逃离，飞船迫降在OM-1行星。 　　瑞克因失职被军事法庭判处绞刑，行刑之际被政府秘密部门救下。阿诺克知晓联邦舰队基地所在地的秘密，一旦被虫族得知将不堪设想。因此政府高层要求瑞克带上一队人马，前去营救受困的阿诺克……

该片讲述了古老的银河共和国表面繁荣，实际暗藏危机，共和国议会议员帕尔帕廷背地里指挥部队袭击了纳布星球，纳布星球女王帕德梅在绝地武士奎刚·金和欧比旺·克诺的帮助下，展开了逃亡。逃亡中，他们发现了一个具有强大原力的小孩安纳金·天行者，并带走了他。随后，绝地武士反攻纳布，上演了机器人大战与光剑之战的故事。

从小异于常人的黑崎一护，在一次机缘巧合下遭遇女死神“朽木露琪亚”。露琪亚是将灵魂从现实世界引领到尸魂界的收魂者之一，他们为保护人类不被“虚”侵害，一直在与这些怪物战斗。在与一只异常强大的“虚”战斗时，露琪亚身负重伤，无奈只能将死神的力量暂时转给黑崎一护，让其代为战斗。两人经过一段时间的磨合后并肩战斗，终于战胜了当年害死一护母亲的“虚”，但在这期间，露琪亚的兄长朽木白哉强迫她不顾黑崎一护的生命安危收回法力。露琪亚为保护一护，拖延到与“虚”的战斗结束，并清除了一护的记忆……

故事设定在28世纪，人类发现了如何进行时空旅行。韦勒瑞恩和洛瑞琳是“时空服务”的特工，负责保护地球帝国的行星。他们像往常一样执行着星际任务，但在执行一次任务时，他们偶然发现了一个秘密，而他们也被卷入其中，越陷越深……

许多年前，宇宙最大魔王弗利萨接连败在超级赛亚人之手，他的残党欲孽则流浪宇宙之中寻找那美克星人的新定居点，以期将弗利萨再度复活。几经周折，军队代理索尔贝利用地球的龙珠把弗利萨带回人间，而这个刚刚复活不久的魔王很快展开了他的复仇计划。半年之后，浩浩荡荡的弗利萨大军降临地球，悟饭、比克大魔王、克林、天津饭、武天老师挺身而出，而孙悟空和贝吉塔则正跟随维斯在遥远的宇宙深处接受试炼。危机时刻，地球被入侵的消息终于传到维斯和比鲁斯那里，悟空、贝吉塔即将与他们宿命中的冤家再度展开对决……