故事讲述21世纪有两位天才女高中生，降临在这个靠打麻将实力来左右人生的时代。一位是每一次都能够以正负0分没输没赢的方式打完牌局的少女“宫永咲”。另一位是在全国中学生麻将大赛个人组中夺冠的少女，经验数据系选手“原村和”。因某次偶然的相会，“和”被“咲”不在乎输赢的打法所击败，对“咲”说出“你不喜欢麻将”这句话。“咲”被这一句话刺激后，一方面激起斗争心另一方面为了追赶姐姐而加入“和”所在的学校麻将部，两位少女就此向麻将界的顶点进发！

娇纵蛮横的小公主商天贝凭着皇太后的宠爱随心所欲,闯祸连连.

纽约的拍卖会场。以3亿美元中标了在第二次世界大战中消失的《芦屋的向日葵》的梵高自我临摹稿的铃木次郎吉，收集了散落在世界各地的7张《向日葵》，准备召开前所未有规模的展览会。但是，在记者会上出现了基德卡，混乱的会场上还出现了新一的身影！载有《向日葵》和铃木园子等人的客机飞向日本，着陆前货仓安装的炸弹爆炸，机体起火。

能一览东京街道的高635m的铃木塔。在开幕仪式中，在展望台的男性客人被外部狙击而倒下。正好在场的柯南通过子弹的轨道中找出了狙击点，但对狙击的射程来说那是“不可能的距离”。和女高中生世良真纯一起追逐狙击手，只差一步却让对方逃走了。日后，FBI和警视厅开始了联合调查，浮出水面的是海军特种部队“海豹突击队”的存在。

某个黑夜，一名间谍潜入日本警察机关企图盗取一份机密文件，这份文件内容中含有英国“MI6”、德国“BDN”、美国“CIA”，甚至还有“FBI”等各国谍报机构的相关人员名单。千钧一发之际，安室透率领的日本公安赶到，间谍夺车逃跑，高速公路大桥上上演激烈追逐战，其他的车辆也被卷入其中，眼看要酿成惨重事故的瞬间，间谍的车被FBI赤井秀一用来复枪射中，从大桥坠入海中。 第二天，柯南等人来到东都水族馆游玩，他们在巨大摩天轮底下，发现了一位独自一人又负伤的漂亮女子，仔细一看她的两只眼睛的瞳孔颜色不一样，也就是俗称的“阴阳眼”。可是，这位女子已经是连自己名字都不记得的失忆状态，带的手机也已经损坏。为了帮助她找回记忆，柯南等人约好了和她同行。没想到，这一切都被贝尔摩德暗中监视着……