「来吧，开始实验吧。」行星探测船从火星带回的神秘之箱“潘多拉魔盒”。从箱中释放出来的能量创造出了巨大的墙壁，日本从此被分成了三部分。10年后，在谜之怪人“猛击者”暗中活动的东都街头，传说存在着为了保护人们而战斗的假面骑士创骑。他的真身是丧失记忆的天才物理学家·桐生战兔。为了解开潘多拉魔盒之谜，为了取回自己的记忆，他的战斗拉开了序幕……

在火星上发现的神秘潘多拉魔盒引发了天空之壁的惨剧，巨大的天空之壁将日本分为东都、西都、北都三个部分。而在东都出现了被称为“猛击者”的未知生命体，不断袭击东都的市民。保护市民免受“猛击者”侵扰的就是由天才物理学家桐生战兔所变身而成的假面骑士创骑。战兔和龙我等人在追查猛击者的过程中，将一步步揭开隐藏在身边的惊天阴谋！

2016年，由于开始侵蚀世界的怪人“BugStar”=未知的电脑游戏病毒侵蚀开始。为了救助感染者，决定与BugStar战斗的天才玩家宝生永梦变身为假面骑士Ex-Aid。

异次元人亚布鲁拥有不死之躯，虽然亚布鲁被奥特战士消灭，但是仇恨的力量，让亚布鲁再次复活。亚布鲁为了报复奥特战士，想出了一个计划。亚布鲁盯上了维克特利水晶之核，它打算利用维克特利水晶之核，复活已经被奥特战士干掉的宇宙帝王亡灵裘达。然而，传说中的超人奥特之王早已察觉此时。所以奥特之王派出宇宙警备队去阻止此事。雷欧、阿斯特拉、艾斯还有希卡利都来帮助银河和维克特利了。希卡利奥特曼将骑士剑笛赠送给了翔，希望翔用骑士剑笛的力量阻止亚布鲁。受到众位奥特战士阻挠的亚布鲁，依然贼心不死，还是打算继续复活宇宙帝王亡灵裘达。亚布鲁召唤出实力强大的超兽去抵挡奥特战士们的攻击，结果，最后还是让亚布鲁阴谋得逞，成功召唤出了宇宙帝王亡灵裘达。最后时刻，翔获得了维克特利水晶之核的力量，成功封印了亡灵裘达，打败了亚布鲁。

和平的岁月稍纵即逝，在银河奥特曼与维克特利奥特曼击败维克特路基艾尔的一年后，神秘的时空城突然在地球上空出现。超时空魔神艾塔尔迦和异世界女战士阿蕾娜夸下海口，要用手中的魔镜封印所有的奥特战士。而此时，迪迦奥特曼、戴拿奥特曼、盖亚奥特曼、高斯奥特曼、奈克赛斯奥特曼、麦克斯奥特曼、梦比优斯奥特曼等都被封印在了时空城里。礼堂光及其所在的特搜队UPG的队友们如临大敌，和前所未有的敌人陷入了苦战。在战斗进入紧张之际，来自另一个宇宙的青年春野武藏和赛罗·奥特曼加入进来。战斗逐渐升级，邪恶势力终将面对全员十名奥特战士捍卫正义与和平的时刻！而作为战斗主力的小光以及翔能否将银河与维克特利的力量融合在一起呢？