精英狙击手布兰登·贝克特（Chad Michael Collins 饰）和理查德·米勒（比利·赞恩 饰）负责保护一个天然气管道免受恐怖分子的袭击。然而在与敌方战斗的过程中一个狙击手的牺牲让他们意识到自己正处在十分危险的境地，因为在他们看不见的地方正有一双眼睛注视着他们的一举一动，自以为隐蔽的藏身点已经暴露，这一切都让他们的安全面临威胁，究竟是有内鬼藏在自己的队伍中还是有着什么他们并不知道的秘密……

1935年夏天，来自一个宽裕的英国小康家庭的13岁的少女布里奥妮（西尔莎·罗南 饰）刚刚开始尝试写作，想象力丰富。一天，她暗中发现仆人的儿子——罗比（詹姆斯·麦卡沃伊 饰）和她姐姐塞西利亚（凯拉·奈特莉 饰）之间有暧昧关系，而且发现他给她写了一封充满情色意味的情书。布里奥妮丰富的想象力虚构着各种可怕的事情，浮想联翩。当她的表姐罗拉（朱诺·坦普尔 饰）被侵犯后，布里奥妮相当肯定她看到是罗比做的，这次指证使罗比蒙冤入狱，留下伤心欲绝的塞西利亚。第二次世界大战爆发了，出狱后的罗比和塞西利亚都投入了保卫祖国的战斗，布里奥妮放弃到剑桥求学成为一名军队医务人员。没有人能理解她的做法，只有她知道她怀揣着巨大的秘密和自责。她鼓起勇气，想把这秘密解开，能真正赎罪和得到宽恕。

1940年4月9日清晨，德国军队穿过国界进入丹麦境内。丹麦日德兰岛的自行车连队和摩托车连队是最先抵御德军进攻的丹麦部队。

经过上一集的腥风血雨之后，伯恩（马特·达蒙 饰）和女朋友玛丽（弗兰卡·波坦特 饰）隐居在印度偏僻的海边小镇，想忘记以前的生活。一天，神秘组织的杀手来到小镇，打破了伯恩二人世界的宁静，女友玛丽在逃亡途中被枪杀。为了查出真相，伯恩重新开始战斗，他发现以前工作的中情局开始重新寻找他，自己被卷入了一场刺杀活动中，被人诬陷破坏了中情局的一次情报交易，杀害特工。伯恩别无选择，他只能找到冒充自己的人，才能证明清白，为女友报仇。

本片翻拍自1978版本《特殊使命小分队》。卫国战争期间，为防止代号为“喀秋莎”的速射炮落入敌人之手，一支由亚历山大·叶尔马科夫指挥的小分队紧急组建并投入前线，他们的目标是发现并摧毁"喀秋莎"。