故事紧承上一部展开。在丈夫为保护家人牺牲后，伊芙琳（艾米莉·布朗特 饰）不得不独自带着孩子们（米莉森·西蒙斯、诺亚·尤佩 饰）面对全新的生存挑战。他们将被迫离开家园，踏上一段未知的旅途。在无声的世界里，除了要躲避“猎声怪物”的捕杀，铺满细沙的道路尽头还暗藏着新的危机。

影片围绕间谍小说作家叶利·康韦（布莱丝·达拉斯·霍华德 饰）的作品展开。叶利的小说讲述神秘特工阿盖尔（亨利·卡维尔 饰）及其瓦解全球间谍集团的任务，而小说中的情节却意外开始与真实间谍组织的秘密行动出现惊人 的一致。在特工艾登（山姆·洛克威尔 饰）的陪同下，叶利带着猫咪阿尔菲穿越世界，竭力赶在间谍组织的杀手们行动之前化解危机，此时小说的虚构世界与现实之间的界限开始变得模糊不清，随之而来的是一场跨越全球的冒险。

国民党军医彭天戈的父亲彭振才受政府秘密委派，假意投敌。彭天戈为证明父亲清白，遭日本特务陷害，被判死刑。民间爱国锄奸组织头领火麒麟将其救下，并将彭天戈培养成令敌、伪胆寒的顶尖杀手。共产党地下特工宋卓凝利用分享者电视军统情报人员的身份多次搭救彭天戈，引导彭天戈走上革命道路，并与之产生感情。由于背负罪名，彭天戈与昔日恋人柳沉雪无法相认。柳沉雪遂与另一江湖杀手杜善起走到了一起。杜善起为日本皇族后裔，被爱国义士杜定海从小收养，却唯利是图。柳沉雪的真实身份是日本特务，她将杜善起推入了日伪的怀抱，沦为特务鹰犬。于是，彭天戈与杜善起在战场上几番较量。最终柳沉雪逃不脱情殇，为救彭天戈丧命。最后一场厮杀中，一对杀手冤家的角逐分出了胜负，杜善起被彭天戈铲除。彭天戈带着重伤的宋卓凝和父亲前往延安。

一个叫亨利的13岁男孩在度假途中，在他的旅行箱里意外发现了一种长着尖耳朵、翘门牙、细尾巴的微型小人——“小不点”。此后，他们就住在亨利卧室的通风道里，亨利的宠物龟也成了他们的好朋友。美国动画片中与孩子们作对的反派角色总是大人，如《丹佛——最后的恐龙》。本片也不例外，阴森的博士和他的助手总是带着高尖端科技的仪器，妄图捕获这些小家伙。凭借小不点们自身的聪明伶俐和亨利无微不至的保护，大人们的阴谋一次次的破产了。

在冬天的夜晚，肯和诺拉在海边的家里为好友举办了生日聚会。他们邀请了久违的朋友一起共进晚餐，但是好友的突然死亡使他们惶然失措。到底什么才是生命的真谛，他们陷入了深刻的思考。