Nikki Grace(劳拉·邓恩饰)和Devon Berk(加斯丁·特奥克斯)在Kingsley Stewart(杰里米·艾恩斯饰)的新片中担任主角，所拍摄的电影片名是《On High in blue tomorrows》。Nikki过于投入到戏中的角色，导致她的生活乱得一团糟。渐渐地，她开始混淆现实生活与她所扮演的人物(Susan Blue)与男主角Devon(在影片中的角色名字是Billy Side)。电影《On High in blue tomorrows》所要讲述的故事是发生在从前的，结果因为两位主角的意外身亡而使得拍片计划半途而废。但是，对于Nikki来说却是越来越混乱。在现实生活中，她的角色(Susan Blue)变得越来越真实，甚至比她自己还要真实……

由于援救浣熊行动的失败，宠物侦探艾斯·文图拉放弃了侦探工作来到西藏修行。然而，非洲某地一只白蝙蝠的失踪又迫使他不得不再次出山。这只蝙蝠是瓦查蒂族的神物，也是瓦查蒂公主与瓦楚图族王子结婚时的陪嫁。婚期已近，如果找不到白蝙蝠，两个部族间就会爆发可怕的冲突。 艾斯·文图拉到达瓦查蒂族后，受到了热情的款待，美丽的公主也对他频送秋波。然而侦探工作也不可放下。艾斯一来就对狩猎者奎因产生了怀疑，然而奎因只承认自己曾去偷过白蝙蝠，但早已被别人捷足先登了。 正当迷惑时，有人向艾斯射来了瓦楚图族的吹箭。怒气冲冲的艾斯直奔瓦楚图部落。他与部落的人们发生了争执，也吃尽了苦头。明白过来的艾斯终于找到了劫走白蝙蝠的两个猎人，查出了幕后的主使者——总领事卡德白。卡德白一心想挑起两个部落间的战争，以期坐收渔翁之利。被揭露阴谋的卡德白想除掉艾斯·文图拉，然而神通广大的宠物侦探却招来了森林中的动物们的帮忙。卡德白受到了应有的惩罚。 战争被阻止了，婚礼如期举行。然而艾斯与公主的私情也败露了，两个部落的人联合起来向他大肆发难。这次，轮到艾斯落荒而逃了。

在亚马逊丛林腹地，探险科学家图里奥和琳达发现几近灭绝的野生蓝色斯皮克斯金刚鹦鹉。夫妻俩通过电视向全世界宣布这一惊人消息，看到这一幕的珠儿劝说丈夫布鲁，打算带着三个调皮可爱并且已经习惯了人类文明世界生活的鹦鹉小宝宝，回到它们生长千百年的故乡寻找同类。鹦鹉一家说走就走，和它们的好朋友踏上充满惊险和乐趣的空中旅程。与此同时，某非法砍伐团体看到新闻，为防止图里奥夫妻阻挠他们的罪行，他们也悄悄采取行动。另一方面，与布鲁积怨已久的葵花凤头鹦鹉奈杰发现布鲁的踪迹，也愤然采取行动。

阿蓝（Jesse Eisenberg 配音）是一只世界上极其稀少的蓝色金刚鹦鹉，当他还是雏鸟时，便被可鄙的偷猎者从里约的热带丛林中掳到美国。阴差阳错，他变成了小女孩琳达的宠物，从此相伴多年，如今的阿蓝俨然一个养尊处优的宅男，甚至到忘记了如何飞行。某天，名叫图里奥（Rodrigo Santoro 配音）的鸟类学家经过琳达（Leslie Mann 配音）经营的书店，他被阿蓝所震惊，并希望能将阿蓝带回里约，与世上仅存的另外一只雌鸟繁衍后代。 　　虽然心怀不安，但是考虑到蓝色金刚鹦鹉的命运，琳达还是带着阿蓝来到里约。阿蓝顺利见到了美丽的同类茱儿（Anne Hathaway 配音）。茱儿则一心逃离樊笼，回归大自然。与此同时，一伙犯罪分子盯上了这群可爱的小生灵……

一群老朋友又将开始一段新的旅程。当猛犸象曼尼沉浸在马上要当爸爸的喜悦之时，剑齿虎迭戈却为自己的逐渐衰老而黯然伤神，此时树懒希德则发现了三枚恐龙蛋，居然母爱泛滥，想作这三只小霸王龙的妈妈，结果被小恐龙真正的妈妈霸王龙掳走。为了寻找同伴，一群可爱的动物朋友们走进了隐藏在冰河世纪之下的侏罗纪公园