斗魂圣地一战之后，为了拯救枯萎的灵界灵树，六支浇灌灵树灵液化作灵树之种，由紫染苍麟带回灵界的灵树圣地栽种。 谁知两人在圣地却遭到月族长老镜影花的袭击，镜影花欲吸收灵树之种的力量完成自己的野心，在苍麟拼死牵制下，紫染带着灵树之种开始逃亡，在被追杀途中意外碰到了从地界过来灵界的斗魂卫张山峰一行人。 得知镜影花要吸收灵树之种然后反攻地界的野心，斗魂卫一行人决定要保护紫染回灵树圣地种下种子。

灵界精英部队入侵人间，在危机中，主角张山峰、上官明月、徐小嫚等人各自踏上艰辛的历练并与灵界敌人展开殊死斗争的旅程。众人的命运交织纠缠，在内忧外患的大世界中，不同的人做出不一样的抉择。无论是敌是友，所有人都为自己的目标挣扎拼命。 在热血悲壮的战斗后面，是形形色色的人性矛盾。面对困境，有人变得脆弱，有人变得疯狂，有人变得坚强，只有顽强正直的心，支撑着人们冲上战场。纵然战斗残酷无情，纵然战斗会受伤痛苦，纵然在战斗中会失去最重要的人和事物，主角们依然勇敢面对。 命运的巨轮无情向前碾压，坚定的意志和自我牺牲是撬动巨轮前进方向的动力。在硝烟废墟中，只有不变的初心，那颗仁慈与大爱的心一直在照耀着前方。

异世界正反两派在一次大规模群架中，正方首领鲁本船长被反派四大恶魔之一的影魔自爆偷袭，身受重创，灵魂寄宿于随身佩戴的刀中，力量变成灵魂碎片散落在异世界各地。失去了领袖的正方被反派打的节节败退，无数的英雄被打成碎片无法复活，剩余的英雄也朝不保夕，只有成为人类的召唤英雄才能够借助人类的力量重新复活逃过一劫。此时，现实世界中主人公谭小基无意间被卷入异世界并且成功唤醒了船长，异世界再掀风云，我们的故事也从此开始。

五法山一战后，各方损失惨重，皆偃旗息鼓。不料上官剑元威逼利诱，势要夺取异天符印，打开藏有地界灵树的斗魂圣地。明月临危受命，当上了灵狩门掌门，为继续追寻自己的身世之谜，带领众人踏上旅途。 灵界日渐衰微，在镜影花的诱导下，六支不得已亲自出马，混入灵狩门欲取异天符印，然而在梧桐村落时，不经意间得知斗魂圣地的秘辛，遂改变主意逗留灵狩门，以窃取更多情报，待时机成熟，一举取得地界灵树。 而明月等人此行的目的便是寻找江湖百晓生，叶知秋。原来当年玄阳族惨遭月族覆灭时，叶知秋是护送了公主上官明月进入地界的统领之一，他在漫长的岁月中忍辱偷生，等待明月的到来。明月得知了许多令她咋舌的真相，上官剑元就是玄阳族的叛徒，玄阳王惨遭月族杀手刺杀，玄阳族一时群龙无首，才会一夜倾覆。 身为灵狩门掌门要守护斗魂圣地，身为玄阳族公主要重振家族，此时此刻明月身负重担却又弱小无助。叶知秋为挽回明月信心，慌称可利用族内信物提升能力，但明月早已过了豆蔻年华，强行提升简直是飞蛾扑火，果不其然，叶知秋修为大减，明月在上月琉的帮助才渡过危机。 一切也都接近了尾声，正当六支准备切断灵树，上月琉阻止了她。拯救灵界无需整颗地界灵树，只需其中的灵液汁和六支这颗种子，便能再次焕发灵界的生机。 灵界危机解除，上官剑元已成废人，天宗门一蹶不振，地界也不再勾心斗角。六支已然成为灵界灵树，明月决定前往灵界寻找族人，而上月琉也踏上新的旅程，斗魂圣地的大门再次关闭，不知所踪。

灵界精英大举入侵人间，危难之际，各大门派与门外散修的斗魂卫聚集于五法山比武聚贤共商对策，然而各个门派势力却各怀己见，并不统一。本是门外散修的小人物张山峰，在机缘巧合中渐露头角，其单纯耿直的个性反而成为众人中的亮点。 在五法山上举行的门宗大会上，众斗魂卫都希望能够团结起来共同对抗灵界的入侵，然而各派的掌门却暗中各有盘算。 张山峰早已知晓这种情况，因此寄望在大会的比试中夺得魁首，从而取得统领众斗魂卫的资格，就可以将众人带领到对抗灵界的正途上。但是就在比试的中途，灵界大军攻打五法山，张山峰和众人奋力抗敌，最终将敌人的进攻计划粉碎，张山峰也赢得众望，为组织抗战队伍踏出第一步。在激烈的抗争中，主角们坚强的意志，从不动摇的决心都转化成坚不可摧的力量，纵然有伤痛与牺牲，纵然有艰难的抉择，只要坚定心中的信念，在众人的团结与努力下，终将排除万难，开创一片新天地。