退役特种兵上校约翰·梅屈克与10岁的女儿詹妮住在山区的别墅里，过着平静的隐居生活。阿里乌斯曾是南美某国的独裁者，现在已经被赶出自己的国家。为了恢复自己的独裁统治，阿里乌斯指使手下绑架了詹妮，胁迫约翰前往暗杀该国的现任总统。约翰除掉了监视自己的歹徒，跳下刚刚起飞的飞机，并从另一名歹徒的口中探知了阿里乌斯的老巢所在。全副武装的约翰驾驶水上飞机独闯龙潭，经过一番激烈的枪战与肉搏，最终消灭了阿里乌斯一伙，救出了詹妮……

当年在努布拉岛营建侏罗纪公园时，约翰·哈蒙德曾把附近的索纳岛作为恐龙的制造工厂。侏罗纪公园沦陷后，索纳岛上的恐龙在完全隔绝且缺少必要合成元素的情况下生存了4年时间。哈蒙德对此颇感好奇，他重新找到马科姆博士，邀请他前往小岛考察。4年前经历让马科姆心有余悸，他断然拒绝哈蒙德的提议，但当得知女友莎拉已前往小岛之时，只得跟随探险队整装出发。在索纳岛上，另一组野蛮的探险队已经先期到达，他们抓捕恐龙将其买到外国。利欲熏心使得这些贪婪之徒全然不顾危险，竟然打起暴龙的主意。索纳岛旋即变成恐怖的屠杀地狱。