国民党军医彭天戈的父亲彭振才受政府秘密委派，假意投敌。彭天戈为证明父亲清白，遭日本特务陷害，被判死刑。民间爱国锄奸组织头领火麒麟将其救下，并将彭天戈培养成令敌、伪胆寒的顶尖杀手。共产党地下特工宋卓凝利用分享者电视军统情报人员的身份多次搭救彭天戈，引导彭天戈走上革命道路，并与之产生感情。由于背负罪名，彭天戈与昔日恋人柳沉雪无法相认。柳沉雪遂与另一江湖杀手杜善起走到了一起。杜善起为日本皇族后裔，被爱国义士杜定海从小收养，却唯利是图。柳沉雪的真实身份是日本特务，她将杜善起推入了日伪的怀抱，沦为特务鹰犬。于是，彭天戈与杜善起在战场上几番较量。最终柳沉雪逃不脱情殇，为救彭天戈丧命。最后一场厮杀中，一对杀手冤家的角逐分出了胜负，杜善起被彭天戈铲除。彭天戈带着重伤的宋卓凝和父亲前往延安。

司马玉龙自中兴复国之后，因念念不忘失踪的太后，化名为楚天佑，在忠义侯赵羽和红颜知己珊珊以及精通医术，为人善良逗趣的丁五味的陪同下，一路边找寻太后，边铲除前朝余孽及贪官污吏，平复了许多人世间的泣血奇冤，深得百姓爱戴。

公元1472年，王伦根据夫人的梦境给刚出生的孙子取名王云，后又改名为王守仁。王守仁出生在一个名宦之家，他少年志高，入仕后明辨善断，为民申冤。王守仁因上疏营救言官而得罪阉党，被廷杖后被贬往贵州龙场驿，在那里王守仁发现了一个山洞，起名为阳明洞。由于王守仁早年就诗名在外，远近诸生纷纷前来就学，一块荒凉不毛之地，就这样成了其乐融融的传道讲学之所。复官后，他整饬吏治，抑强止盗，减轻民负，又率军平定宁王叛乱，维护社会安宁。因皇帝昏庸，政治腐败，小人猖狂，他极度失望，心力交瘁，但其学说却广泛流布，影响后世。

该剧讲述了朱一品和他的探案小分队即将面对可怕的新对手，医馆里的年轻人也团结在一起，面临重重疑案，齐心协力找出真相的故事。幽默风格、武打动作、悬疑剧情，而随着故事内容一步步的深入，朱一品和他的伙伴们的命运也将随之改变。

1937年，抗日战争爆发。南京守城军官的石永凯在南京保卫战中结识了中国共产党地下党员袁玉婷、大学教授周永民、国军士兵许秀岚、帮派首领林万龙、民间手艺人陈熹年、爱国富商彭松祥等人，他们团结一致，成功保护大部分幸存的南京市民和朝天宫国宝。