森林深处的远古陵墓中，精灵家族正在筹备一场盛大的生日派对。13岁的小寿星鲁道夫不听爸爸妈妈的话，引来了邪恶的精灵猎人，让族人陷入了猎人的天罗地网中。猎人残暴无情，利用各种高科技武器追杀鲁道夫一家。在逃亡路上，鲁道夫与家人走散，闯进了13岁男孩托尼寄宿的城堡中。和别的人类不同，天真阳光的男孩儿托尼不仅不惧怕精灵，还对鲁道夫十分友好，不仅照顾他，还愿意瞒着爸爸妈妈和鲁道夫一起对抗精灵猎人。可是，鲁道夫的家人却并不信任托尼。直到危急时刻，托尼救了鲁道夫一家，才赢得了精灵们的信任。一次次被两个小孩挫败的精灵猎人气急败坏，决定拿出终极武器，先消灭被困在远古陵墓中的精灵族族人。托尼和鲁道夫不顾自身安危，一次次化解了危机，最后，在家人们的帮助下，彻底打败了邪恶的猎人。终于，精灵和人类跨越了种族的藩篱，成为了好朋友。

在不久以后的未来，米歇尔·布莱德利（西格妮·韦弗 Sigourney Weaver 饰）的大型军火公司，制造出了全球第一批机器人警察，并派遣它们执行任务。程序员迪恩（戴夫·帕特尔 Dev Patel 饰）是机器人警察的制造者之一。但他在工作之余，还有自己执着追寻的梦想：人类进化的下一步，“能思考，有感觉”的机器。 迪恩向米歇尔·布莱德利寻求支持未果，转而利用公司的设备自行开始制造和实验，并成功地将拥有人工智能的机器人“查派”带到了这个世界。查派性格天真可爱，像个孩子一样不断学习，然而能够语言，能够思想，能够作画的机器人，引发了米歇尔·布莱德利，以及文森特（休·杰克曼 Hugh Jackman 饰）的恐慌，文森特驾驶机器战士找到迪恩，意欲除掉机器人查派，人类与机器之间的大战再度爆发……

主题依旧是世界的毁坏和损失，因为在第五部结尾处，整个世界只剩下最后一个白宫角落可供人类抵抗红心女王。为了给整部系列一个完整饱满的结局，前几部中的人物和主题都将回归画成完整一个圈，大结局将会循环回到第一部中的人物和主题，将整部系列六部影片串联起来。这就是为什么红心女王和米歇尔-罗德里格兹的角色回归到《生化危机5》，一切都是为回到蜂房，回到第一部做准备。