行运茶餐厅餐厅老板（吴孟达 饰）每天都乐于在茶餐厅中忙前忙后，他的儿子阿男（陈晓东 饰）却非常嫌弃，一次他在遇到了离家出走的富家女芳芳（舒淇 饰），芳芳还跟了他回家，父亲以为他们是男女朋友的关系。此时，阿福（葛文辉 饰）送外卖时遇到了Fanny（杨恭如 饰），便向何金水（周星驰 饰）这位情圣请教，可是何金水也遇上了当年的初恋情人Cindy（郑秀文 饰），Cindy借故报复当年的恩怨，令何金水患得患失。 茶餐厅被勒令收回，全茶餐厅的人都决定要抵抗到底……

零零恭、零零喜、零零发（周星驰）、零零财是宫廷四大高手，专职保卫皇帝（张达明）的安全。虽号称四大高手之一，零零发实际上只会搞些小发明完全不会武功，某次因为未完成皇帝交办的捉拿江湖四大怪杰的任务，他被开除出宫。回家后，零零发开了一家妇科诊所，时常会用一些小发明讨得老婆（刘嘉玲）心花怒放，日子也算怡然自乐。 金国以“天外飞仙”尸体为由头将皇帝从宫中骗出，并伺机杀死了紧跟皇帝的三大高手，关键时刻，零零发用他发明的“直升机”和“机关枪”救皇帝一命。不死心的敌手随后派来名妓琴操（李若彤）引诱零零发，零零发与老婆将计就计演起双簧。

常家大哥常满（黄百鸣 饰）事业有成，可是却嫌弃家中老婆程大嫂（吴君如 饰）是个黄脸婆，不懂打扮。程大嫂每天在家服侍老人痴呆的公婆，深得常骚（张国荣 饰）与常欢（周星驰 饰）的喜爱。娘娘腔常骚与“男人婆”表姑妈梁无双（毛舜筠 饰）是一对死对头，可在两人同时受到感情伤害的时候，萌生爱意。常欢是出名的花花公子，却意外撞坏了脑子，女朋友何里玉（张曼玉 饰）还是愿意留在他的身边。当个人都心有所属时，却要帮大哥想办法挽回与程大嫂的感情。

多年来远离战乱，岁月安好的“无常镇”接连发生了一连串的意外死亡事件。侦缉队警察陈墨在调查的过程中，救出了溺水的少女白霜。他们一次次赶赴死亡现场，却一次次与死神擦肩而过。众目睽睽下的意外死亡，到底是天灾，还是人祸？

本季是由几个有趣的小故事组成的，具体是指在这个疯狂的动物城中，观众们所熟知或曾在电影中未被引起重视的大小人物的背景故事以及曾经错综发生在电影之中那些大小事件背后的不为人知的小故事。其中有一个故事就是讲，当初那个被朱迪救下的老鼠大佬家的女儿的事。那天，在她被朱迪从大甜甜圈底下救出前后的时间段里，她到底发生了什么事情呢？原来，在本季中讲述了她办婚礼前，因为要从所有要好的亲戚朋友中选定自己的伴娘，反而和曾经因为误会而失联很久的儿时好友再次有了联系，有些事情是除了当事人，外人永远无法理解的，这恰巧是她们之间那又爱又恨的永不磨灭的闺蜜之间的小故事；既然有婚礼前的小故事，那一定少不了婚礼上发生的事情咯。婚礼上，老鼠大佬将家族移民振兴的故事也娓娓道来，让观众们进一步了解了，小小的老鼠家族是如何在动物城里深得民心后而振兴的，也讲述了与追随他多年的北极熊家族之间的真挚感情和感人的过往。还有一位是观众们都非常熟悉又自带搞笑特质人物的小故事，那就是慢性子闪电在他飙车被朱迪拦下之前，他到底发生了什么呢？一个出乎意料的关于闪电的故事，随即带给喜爱他的观众们。