《镖行天下前传之燃眉危机》讲述右玉关在番军的长期围攻之下岌岌可危，奸相严嵩把持下的朝政却坐视不管，右玉关守将杨选只有率部顽强抵抗，苦苦等待友军支援的粮草。平安镖局押送的粮草于纷飞的战火中安全送达右玉关，无疑给已经断粮三天的右玉关雪中送炭。平安镖局副总镖头谷平安将押镖的粮草交付给守将杨选，获悉番军最近虽不攻城，却接连向城内抛扔死尸。 谷平安当即赶到城门处察看番军抛扔进城的死尸，发现每具死尸上都有不同程度的黑斑。谷平安押镖行走江湖多年，见多识广粗通医术，知道死尸上的黑斑乃传染性极强、病死率极高的黑斑病。谷平安、王兆兴在察看完右玉关的殓尸房准备集中处理的尸体之后，更加坚定番军通过黑斑病将右玉关变成一座死城的企图。 黑斑病在右玉关迅速蔓延，城内民众和兵士感染上黑斑病的人数不断增加，如何根治黑斑病、制止黑斑病在右玉关蔓延，成了能不能守住右玉关的关键所在。守将杨选想到了右玉关的郎中，奇怪的是右玉关所有的郎中都在一夜之间消失。与此同时，京城传来的谍报说，京城张太医在太白楼齐聚中原名医时，遭不明杀手系数杀害。 右玉关被番军抛扔传染性极强的黑斑病死尸，京师、乃至中原各大名医遭劫杀，绝对不是简单的巧合。守将杨选不慎感染黑斑病后，挽救右玉关的任务就落在王兆兴和谷平安的身上。绝望之时，王兆兴想到番军既然敢用黑斑病攻取右玉关，势必事先找到防治黑斑病的秘方。 王兆兴的推断一点没错，番军副将窝阔台在蓄谋黑斑病攻城之前，通过右玉关的一名郎中事先找到防治的秘方。王兆兴、谷平安暗中侦查，抓获与番军副将窝阔台交易的一名郎中，得知真正能根治黑斑病、救右玉关于将倾的，只有二百里开外蜂鸣山的天华药师。王兆兴与番军交手时不慎感染黑斑病，寻找天花药师的任务落在了谷平安的肩上。 谷平安带着两名镖手冒着生命危险赶到蜂鸣山，发现天华药师的住处早已遭番军破坏，天华药师生死未卜。谷平安在一座石碑上发现秘方，更找到难得一见的药引龙柏叶，顺利回到右玉关，当即熬制汤药，及时挽救右玉关满城民众和兵士。谷平安成为右玉关的救命恩人，番军功亏一篑，望城兴叹，败北而去。

中秋之夜，西门吹雪和叶孤城约定的决战紫禁之巅，因为西门吹雪临时提出延期而改到九月的月圆之夜。消息传出，坊间议论纷纷，更有好赌之徒以决斗结局下赌，城南大户杜桐轩和仁义满京华的李燕北就是其中的代表。李燕北将全部的赌注都押在西门吹雪身上。决斗在即，李燕北却遭到黑衣蒙面人的袭击。是谁在决战之前袭击李燕北？难道是那些押注于叶孤城获胜的赌徒？如此，杜桐轩难脱干系。 陆小凤还没来得及摸着头绪，就从欧阳情那里得知杜桐轩被杀的消息。为查明杜桐轩死于何人之手，陆小凤通过鬼孙大爷找到大智、大通，岂料龟孙大爷遭人陷害后，陆小凤才知道龟孙大爷就是大智、大通。龟孙大爷断气前念叨一个“马”字。龟孙大爷刚死，在李燕北的府上李燕北和欧阳情遭人荼毒。李燕北当场暴毙，欧阳情命悬一线。 为救欧阳情于不死，陆小凤先后找到胜通法师和叶孤城。胜通法师无能为力，叶孤城连自己中的四川唐门大公子唐天容的朱砂毒都解不了，就更别说欧阳情中的西域之巅的冰寒之毒。此时，陆小凤转而问计于京城泥人张。就在陆小凤通过泥人张发现此事事关南平王府的线索时，陆小凤也遭李燕北的夫人十三姨太的暗算，好在西门吹雪及时出现，不仅救过陆小凤，连欧阳情也一并解毒。 醒来后的欧阳情拿出一块佩玉，通过皇宫大内侍卫魏子云，陆小凤得知此玉乃南平王府的权利象征。由此，陆小凤断定杜桐轩和龟孙大爷的死与南平王府有关。事已至此，时辰将近，西门吹雪和叶孤城的决斗一触即发。陆小凤凭着魏子云发放的缎带进入皇家大内，却发现凭缎带进入大内的远不止原本的五条。决战开始，叶孤城未曾出剑就被前来寻仇的唐门二公子毒气致死。然而，揭开死者的面具，竟然是胜通法师。 真正的叶孤城在哪里？顿时，“护驾”的警觉在陆小凤的心中闪过。果然，不出陆小凤所料。南平王府的世子以其酷似当今皇上的长相，妄图在大内王总管和前朝亡君后裔叶孤城的协助下，谋刺皇上，取而代之。在叶孤城看来百密无疏的计划，被陆小凤一一揭开。有陆小凤和西门吹雪护驾，皇上安然无恙。重新回到紫禁之巅，叶孤城在决战中垂败于西门吹雪，野心勃勃的复仇计划遂宣告破灭。

上海华界和租界一连出了几个命案，经调查死者曾经都是多年前一家名叫“东亚书院”的学校教员。这家学校由日本人开办，其中有部分中国教员，专门收留中国孤儿。凶案中涉及到一个无辜的退休巡捕老薛头……

府库库丁钱有余找到平安镖局要求护送其妻儿出边境，钱有余铁公鸡般斤斤计较的作风令镖局众人极为不满，然而谷平安却因其对老婆孩子体贴入微颇为欣赏。可是到了第二天中午仍不见钱有余前来约定地点会合，同时钱妻见不到丈夫就不出关让镖局非常为难，王兆兴决定回城去找钱有余，却发现钱有余不断被人追杀，而且追杀者皆为官府之人，王兆兴甚感疑惑，再三追问下，才从钱有余口中得知，原来钱有余发现了上司郑青云贪污官银的罪证，郑青云为了除掉钱有余为其扣上贪污犯的罪名并全城缉拿。为了洗脱罪名，王兆兴与钱有余置身前往府库一查究竟，却中了郑青云的埋伏，一场激战之后，一桩官府监守自盗的贪污大案终于告破。钱有余也从中得到教训，从此正直做人。

法租界展开“禁烟大行动”，黑帮的大批鸦片被缴获。韩非偶然卷入了一场酒楼枪战，死者是西捕房的探员，而逃逸的凶手阿连则是麒麟帮的小弟，调查刚开始，西捕房探长李约翰欲跟钟朗争这个案子，令钟朗隐约感到西捕房内部有黑幕。不久，阿连落网，审讯中道出一个神秘人指使他带着一笔巨款去酒楼，完成一宗购买白粉样品的交易。钟朗感到案情疑云重重，正欲进一步审问，阿连竟然被人神秘地毒死在审讯室。钟朗小组顺藤摸瓜，发现一切线索都指向西捕房内部。恰在此时，西捕的探长李约翰又被人所害。几经周折，巡捕房的黑幕逐渐揭开：原来，西捕房内部的黑手意欲趁“禁烟大行动”导致鸦片在全上海断货之际制造出国外最新型的毒品海洛因进行倾销。 而这个幕后黑手居然是……