跨越时空苏醒的光之巨人特利迦奥特曼，苏醒了！3000万年前，一股黑暗力量使世界陷入恐惧。最后是光之巨人将黑暗封印到了遥远的宇宙中。不过，光之巨人也用尽了自己的力量，在红色星球上陷入了长眠。时光流转，地球和平同盟“TPU”在地球组建了精英小组“精英胜利队”。主人公真中剑悟生活在新开拓的火星上，他有一个梦想，就是守护大家的笑容。剑悟平日里在植物研究中心工作，他是名植物学家。最近他总是重复做一个恶梦，梦里总出现一名神秘的巨人，这让他十分苦恼。有一天，超古代封印的黑暗突然再次来袭，打破了火星安稳宁静的生活。当火星的街道被怪物破坏时，剑悟在命运的引导下，和沉睡的光之巨人相遇了。这次相遇会给他和地球带来怎样的影响呢？

进次郎被噩梦所困扰。他梦到了曾经光之巨人奥特曼与怪兽“芝顿”对峙的梦。而且，他现在遇到了全新的问题，那就是日渐增强的奥特曼之力已经渐渐难以控制了。就在这段时间发生了假冒机动奥特曼破坏街道的事件。世界上“奥特曼危机”的舆论愈演愈烈，科特队陷入了口诛笔伐之中。只不过，这些全都是某个外星人的阴谋罢了。其中的幕后黑手居然是艾德！艾德目的只有一个，终结地球人对于奥特曼的信仰。为此，艾德引导进次郎走向成为光之巨人的道路，然后再打败进次郎。 巨大化的芝顿被艾德召唤并与科特队展开了激烈的战斗。奥特六兄弟与玛丽装甲集结，并肩作战。艾德身穿自己的芝顿装甲登场，最后的危机时刻来临。进次郎也穿上了全新的装甲去迎战对手。

终极一战，银河之巅！

犯罪都市，米花镇——一道漆黑的人影降临到这个犯罪数量世界顶级的城市……为了目标而到东京来的此人一切都处于谜团之中。其名……犯人犯泽先生（化名）！

地球已经很久没有遭受怪兽的侵害了，似乎恢复了和平。人类将目光进一步转向宇宙，因此对抗怪兽灾难的队伍规模也在逐步缩小。而就在这时，神秘宇宙漂浮体“斯菲亚”突然向地球发动攻击。地球与宇宙的联系被斩断，变成了“孤独的行星”。斯菲亚的恶魔之手也逼近了主角明日见奏大的日常生活，它不停地破坏，最终从漂浮体变成了巨大的形态……奏大不顾危险、勇敢地挑战敌人，终于变身成德凯奥特曼。“就是现在，上吧！”奏大手握德凯奥特曼的“光”，为了保护昔日的和平奋勇迎战。为了对抗斯菲亚，新精英队“GUTSSELECT”重新建立。奏大作为新“精英胜利队”的新队员，与年轻的伙伴们一起对抗巨大的敌人。