- 影片剧情继续围绕失忆后的时矢展开。某日，时矢和佐相路过人气小说家的签售会，而小说家嵯峨恰巧是时矢大学时代的恋人。与此同时，某经济评论家被发现死亡。但奇怪的是，在尸体的口中发现了一张纸，纸上写有 “第一凶手是河上彦斋 ”的字样。河上彦斋是江户末期在京都进行刺杀活动的四名武士组成的 “幕末四大刽子手”之一。几天后，类似的案件再次发生，死者口中仍然发现了手写纸条。调查案件之时，时矢的脑海中经常出现自己身为侦探的画面，而在死者口中发现的纸条，也被证实字迹与时矢完全一致。更加匪夷所思的是，连环杀人案的一切居然与时矢大学时所写的侦探小说一模一样，时矢在查案的同时也开始寻找自己丢失的记忆。
- 2020年，被选召的孩子们都长大成人。伴随着未知数码兽的出现，平静的生活被打破，世界即将再次掀起异变。在所有人的命运即将改变之时，八神太一等人再次集结。然而，伴随着战斗的拉响，他们面临与数码宝贝的分别。自1991年夏天开始的漫长冒险，即将迎来终结之时。这是八神太一和数码宝贝们故事的最终篇章，这是他们最后的冒险。
- 故事讲述10岁的木之本樱（昵称小樱）打开了她父亲所藏的魔法书，意外把有魔法力量的“库洛牌”释放。由于她把牌弄失了，要负责寻回，于是看守库洛牌守护兽可鲁贝洛斯，便给予小樱封印之杖（封印之杖的封印除解除前像一把钥匙，小樱便把它当作项链戴在颈上），任命她为“库洛魔法使”，陪同并帮助小樱寻找回库洛牌。随后的故事，围绕着小樱寻找和收服库洛牌的经历而发展。在库洛牌收服完后，通过了身为审判者的月之考验，成为库洛牌的新主人。一天，一位神秘的转校生柊泽艾里欧出现，他引发许多不可思议的事件，促使小樱将库洛牌转换为樱之卡，也避免了库洛牌魔力消失的危机。 除了透过寻找、使用魔法牌的经历，开启了一个幻想世界外，故事也描划角色间对身边人的爱。由友爱、家人的爱至恋爱等皆包含其中，“没有想伤害别人的人”之世界则是故事的基本舞台。这本著作和CLAMP其他著作最大的不同点在于“没有流血的画面”（除了漫画版中小狼对上“击”时有些微的流血画面以外）。
