本片讲述了一个科幻悬疑的故事：翼生与林溪为查明校花消失的真相，被牵扯进一个巨大的科技阴谋中，一切都源自叶芊和翼教授在科学实验中的矛盾分歧，叶芊认为长久的实验研究得出了成果就应该公之于众，用于临床，为了科学的进步所有的牺牲都是值得的；而翼教授认为，再伟大的科学成果，如果他违背人性都应该立刻制止。

南宋都城临安府内突发命案，民众纷纷传言是夜游神所为。京城临安府府尹夏侯言请宋慈前来相助。宋慈发现死者口中有迷药的气味，推断出凶手就是死者府上的厨子。当宋慈和仵作古雪乔调查厨子之时，又一起命案发生，死者是主持礼法祭祀的礼部侍郎。凶手作案的手法与第一起命案一样，并且在案发现场都有一支黑羽。通过综合两名遇害者的行踪记录，宋慈发现二人同时出现在过一个地方——玉栏仙苑。宋慈和古雪乔赶到玉栏仙苑，并找到了曾经接待两名遇害者之人——外域女子伊娜。宋慈判断夜游神一定与外域有关，而一切指向就是明日的明堂大礼。大礼之日，御史大夫史献忠联合外域众人将太子绑架，最终宋慈等人齐心协力将外域之人制服，并将史献忠绳之以法。

赛车手林闯爱慕竞争对手梁梓，他不仅在赛事里努力追逐梁梓，私下也始终厚着脸皮追求。一次沙漠赛事，梁梓半途主动退出，原来她是为了去寻找在沙漠里失踪的父亲。当晚补给站遭遇神秘生物袭击，林闯和同伴侥幸逃脱，而梁梓因提前出发寻找父亲逃过一劫。神秘生物、失踪父亲、废弃工厂之间似乎有着紧密联系，风沙之中神秘生物终于现身，他们能否全身而退？

乐阳是一个真诚纯洁、乐天向上的男孩，他积极探寻并和小灵兽成为了朋友。同时，来自不同时空的伙伴们也在探寻着灵兽，在这个过程中，乐阳用真诚和爱心感染了大家，竞技对手成为了好伙伴，一起解开灵兽的秘密。坏人想要利用灵兽来实现野心，但乐阳的真诚和纯洁化成了灵兽的核心力量，让坏人的野心破灭，帮助大家恢复了安宁的生活。

《重明卫：大明机密》是由搜狐视频、快进文化、兴格传媒联合出品，快进文化承制，青年导演闫乐阳执导，人气演员李川、陈烨林、余玥等主演的国内首部少年热血古装异能励志原创网剧。