在未来世界里，生命大量灭绝，粮食极度匮乏。致力于利用高科技研究物种的罗福斯生命集团身陷遗传混乱危机，始终无法创造出完美的种子，人类生存受到威胁。

在浩瀚的宇宙中，经过长期岁月辗转，被秘密选召出的四个小动物，作为“迷你特工队”保护地球的和平，他们是最强战士：弗特、塞米、露西、麦克斯！数百年后宇宙海盗丹丹团三人组——卡拉、丹特、丹乔，在某个小行星发现了被封印的外星人杰苏，并解开封印让其重见天日。杰苏的力量源于生命体所散发出的负面情感（恐惧、伤心），被称作不幸能量。这伙邪恶势力筹划在地球不断制造危机，并从地球上的生命体获得不幸能量。迷你特工队为保护地球，与邪恶势力展开了激烈的战斗！，迷你特工队全员到齐了，这次，迷你特工队化身为玩具，在我们熟悉的城市，这次，迷你特工队们又会遇到怎样的挑战呢，我们一起期待吧！