长平市机场，经验丰富的的飞行员赵志强，机敏地避免了一场重大事故。飞机着陆后，人们发现油箱中被加入了遇热速熔的化学成分，如非及时发现采取措施，定然机毁人亡。而关键问题是，乘坐这架飞机的是一位中央领导。省安全厅和市公安局立即着手调查。由于这位领导刚刚视察完长平集团113研究所即将完成的研究项目，K2导弹制导系统，准备离开并向中央汇报，择日进行演习，这起事故很可能涉及国家安全问题。安全厅派出侦察处长邱枫带领反间谍小组参与调查。

自清雍正以来，乐家老店同仁堂被钦定为“御药供奉”，至乐家第八代已声名大震。病家闻名纷纷求药，而日本浪人小野勾结在乐家长大的曹化伦，蓄谋夺走密方药谱。甲午战争，清军赴朝鲜抗敌。乐宏达赶造出十万包“诸葛行军散”，赠送将士，却被药材商人借机抬价，欠下巨款。年关债主逼债，乐宏达借贷无门，愤而变卖祖宅。药材商人得知赠药原因，慨然放弃债权。老店又一次绝处逢生。老店在废墟上重张，乐宏达却因饱受摧残离别人世。弥留之际，正值他的儿子乐同仁满岁“抓阄”。在满桌的官帽、元宝、笔墨、绸缎之间，小同仁却抓起了《同仁堂药典》。

全剧通过《红樱桃之谜》、《电梯谋杀案》、《新娘之死》等10个独立成章的侦破案组成，通过起伏跌宕、疑云重重的情节设置，表现了探长欧光慈和他的伙伴利用独到而严谨的逻辑分析，从细节入手，抽丝剥茧揭开谜团的过程，塑造了睿智而又细心的全新公安人员形象。