该剧改编自徐贵祥原著小说《马上天下》。1928年大革命时期陈秋石为逃避父亲安排的婚姻，在进步青年赵子明的帮助下走上革命道路，被派往黄埔分校学习军事。瘦弱的他却颇具战略天赋，在恩师栽培下成长为将才。因信仰不同最终与恩师分道扬镳。抗日战争爆发，他带领部队以少胜多，屡立奇功。但擅自改变战术，违抗上级命令，使他数次遭贬，几起几落。十七年未回家，从未谋面的儿子陈三川成为其队伍中一名英勇战士，因恨父亲当年对母亲的绝情而拒绝相认。陈秋石满怀愧疚，默默悉心培养、调教着儿子。陈三川对父亲的态度渐渐有了改观。解放战争爆发，陈秋石因掩护战士被炮弹击中。病床前，父子二人终于相认。其后两人联手在战场上谱写出一部感人的战场传奇。

下岗工人马冬生（张国强 饰）因为女儿马瑾突然得重症，蒙面抢劫了一家“黑店”。这家店的老板李兵当年曾强暴过马冬生的徒弟，负责此案的刑警队长于超（何冰 饰）竟是熟人。但是这起案件却带出了一桩贪腐案件和制贩毒大案。李兵的姐夫副市长陈子韬千方百计地想掩盖真相，甚至制造出让人顶包的闹剧。不料，马冬生没有就此逃脱，他以匿名信的方式，向于超揭露了这个阴谋，并承诺自己会投案自首。　　随着案件的侦破，于超意识到犯罪嫌疑人就是马冬生，同时也弄清了马瑾的病因实为一个制贩毒团伙的“人体试验”所致，被陈子韬控制的市公安局副局长谭季平，充当了“保护伞”。然而，于超的恪尽职守的品格也感动了马冬生，他选择了自首，这也是于超留给他最后的机会。

一场灭门惨案，让原本逍遥浪荡的关宏宇成了在逃的通缉嫌犯。身为刑侦支队队长的双胞胎哥哥关宏峰，誓要查出真相，但出于亲属回避的原则，警队禁止关宏峰参与灭门案的调查工作，关宏峰义愤辞职。调任了代支队长的周巡处于破案压力，也为了追寻关宏宇的下落，他设计让离职的关宏峰以“编外顾问”的身份继续参与各大重案要案的调查，而警队所有人都被隐瞒了。由于罹患“黑暗恐惧症”，白天和黑夜出现在警队的“顾问关宏峰”，其实是由孪生兄弟二人白夜分饰，性格迥异的兄弟两人在警队中马脚不断，背负着随时被周巡及各路人马发现的危险，一路侦破了各种大案要案，目的只是想伺机调阅灭门案的案卷查出真相，以还清白。

甜美少妇赵千雪子有段完美婚姻，完美丈夫，但最近丈夫郑植却声称，被不可思议的灵异现象所纠缠，事关一周前，在郑植家门外上吊自杀的死者孙小雨。市郊殡仪馆内一具尸体不翼而飞，嫌疑人锁定是殡仪馆退休员工徐丽萍。而后群众报案，城外荒林出现一具焦尸。秦明勘验，尸体遭受虐待焚烧，经身份确认，正是孙小雨。物证同样指向郑植的母亲徐丽萍。然而当林涛上门调查时，却发现盗尸案嫌疑人徐丽萍已自缢身亡……自杀案引出盗尸案，嫌疑人自杀身亡，背后究竟有何隐情？

1932年淞沪抗战期间，化名陶兰的日特策划毁灭中共地下党小组，清洗助战抗日的上海帮会排会。潜伏在排会的地下党员沈放死里逃生，接洽新的党组织烽火小组，调查前党小组和排会遇袭真相，后因斗争需要脱离排会打入敌特，遭追求进步的妻子洪瑾儿误解，排会分裂。1936年，陶兰冒充地下党潜回上海，与其安插在国民党特务机关的爪牙元杰勾结，拉拢排会陷害沈放，迷惑烽火小组，推行旨在破坏抗日激化国共矛盾的苍龙计划。沈放和烽火配合，迷惑国民党反共势力，积极引导洪瑾儿，争取排会长老昌叔和主张抗日的国民党干员周一帆、陈白羽，破获并粉碎苍龙计划，跟陶兰元杰彻底清算，付出巨大牺牲，取得胜利，团结抗日力量，投入全民族抗战洪流。