1948年初，青城发生了一起美军被刺杀案件，特调局要员俞北平（陈建斌饰）被派往青城调查此案。他深知特调局委派自己调查此案的深层目的，旨在甄别自己的身份。深陷危机的俞北平在青城见到失散多年的亲生女儿。女儿身份神秘，正在调查自己。俞北平与现任妻子的女儿徐丹妮在青城上大学，思想左倾，对父亲特务身份嗤之以鼻，正爱着一名有家室的教授，让俞北平很苦恼。俞北平一方面要完成组织最高任务，一方面小心翼翼保护着...

讲述来民国初年，在风云际会的上海滩，一个平凡的小警察邢佳栋饰演的陆常有被推到来时代的风口浪尖，继而发生的种种感情、革命、斗争故事。该剧有个特别之处就是引进了一个全新的行当-翻戏党，导演谭友业表示，该剧故事将镜头对准纵横江湖数百年传奇行当雁门，民国时期又名“翻戏党”，“这一门算是江湖中上的地下党，专以诈术、设局骗取金银财宝，他们这些人是江湖几大门最有智商和谋略，专干大买卖。”

1927年，白色恐怖笼罩中国。 中共地下党夏风和朱雷在咖啡厅秘密接头时，遭到国民党特工高扬伏击。朱雷十二岁的女儿朱美云，亲眼看见父亲死在自己面前。夏风重伤被俘，他的未婚妻、进步学生陆玫，强忍悲痛，带着朱美云匆匆逃离。十年后，上海沦为孤岛。已是中共炸弹专家的陆玫与组织失去联系，流落上海。成长为狙击手的朱美云一心为父报仇也返回了上海。两人与仇人高扬不期而遇。民族大义下，他们求同存异。爱国护士孟香兰，青帮阔少赵非以及保镖叶三，女游击队员铁妞等先后加入，一支独特的敌后抗日小队就此成立。

唐山大地震之夜，涂强从烟囱上跌下身亡，在场的只有尤玲。尤家在旁人的唾沫中渡过了五年，涂强的弟弟涂刚一直守着尤玲，默默鼓励她。五年后，尤玲和马晓建恋爱，遭到双方父母极力反对。涂刚在家人的安排下与刘青定亲。马晓建生意失败，尤玲向港商借钱盘下饭馆，希望和马晓建重新创业，然而马晓建认为尤玲背叛她，独自南下。尤玲怀了马晓建的孩子，瞒着众人将孩子生下来……

1930年，十三岁的林语慧因为是庶出而失去母亲，跟着养母从上海到了南京。为了生计，每日陪着养父沿着秦淮河畔寻觅生计，五年后的偶遇父亲的故友陈默人，被带进新的家庭，与陈沛文兄妹及仆人高伯之孙——高金榜相识，以一个普通女孩的身份继续着忍辱负重的生活。因为父亲林楚沧与陈默人有过指腹为婚之约，她只好将与高金榜的爱情深埋于心，在日寇的铁蹄踏遍南京之时，用孱弱的肩膀挑起了救助难民、保护至死不做汉奸的陈默人的大任。令她未曾想到的是，一直不愿接纳的未婚夫积极走向革命，曾经深爱的人却一步步成为民族的敌人。她在强敌遍布四周的南京，巧设计谋除去民族的敌人；又以民族大义鼓励向自己表达真爱的未婚夫走上更广阔的革命之路。林语慧，一个秦淮河畔的普通女孩，以平凡的歌声唱响了战争年代的南京爱情故事 。