人类曾在遥远的过去与怪兽战斗。如今是宿有怪兽之魂的少女们在地球上诞生的时代。成为GIRLS成员的阿基拉、米克拉斯、乌英达姆稳步成长，每天过着充实的生活。然而有一天，新品种的“影子”引起了麻烦……

在某所中学的美术社里，有一位具有绘画天赋的男孩子。然而他唯一的兴趣是“绘制自己理想的二次元新娘”，与此同时，在以男孩为中心的美术部当中还聚集着一些看似完美却又让人颇感残念的角色。

在人类经过与怪兽的漫长战斗之后获得了和平的时代，寄宿着怪兽之魂的少女们在地球上诞生。人们如此称呼拥有变身为怪兽能力的她们——Unidentified Mysterious Girls，即“怪兽娘”。这是背负着坎坷命运的强大、梦幻而美丽的怪兽娘们的悠然物语。

　　“兔子～兔子～”天真地边这么唱着歌，边为了高中入学寻找著寄宿地点而迷路的心爱，意外发现了一间名叫「Rabbit House」的咖啡店。当心爱一边喝着咖啡，一边询问地点时，才发现原来这里就是自己正在寻找的寄宿之家。由于心爱就读的高中规定，必须帮忙寄宿的家庭工作以当作借住的报答。于是心爱便自称是智乃的姐姐，成为了「Rabbit House」的店员，展开一段新生活。心爱在店里

夏洛克、妮洛、艾露克露、柯蒂妮娅四人使用Toys和超群的团队合作解决无数事件的「Holmes侦探学院」的大人气人物。她们组成的「Milky Holmes」不仅是学园的学生还是真个欧洲市民们的憧憬对象。但是，在一个暴风雨的晚上和宿敌「怪盗帝国」的战斗途中4人突然失去了Toys从而命运开始发生了巨大转变…