故事的舞台为近未来时期，日本列岛西南方的“碧岛”。这座岛屿被五大财阀之一的“东江”买下，约1/3改造成宏大的娱乐设施“白金牢笼”。许多人受东江的巨额补偿搬向其他地方，残留下的居民仍旧居住在“旧住民区”。 在旧住民区商店“平凡”打工的濑良垣苍叶，和外婆及犬型智能伴侣——莲——一起生活，过着还算平静的日子。 但他从以前开始，就受原因不明的头痛困扰。同时，大批倾慕他声音的人时不时的电话骚扰也让人烦不胜烦。这天，接到订单去送货的苍叶，在路上不知为何被卷入了异空间中，被迫和怪异的东西战斗——

传奇大盗鲁邦三世和他的战友次元大介、石川五卫门来到东京，以怪盗基德之名挑战日本警察和柯南。在此之后，鲁邦高调寄出预告书，扬言要盗取某银行内的稀世珍宝樱桃蓝宝石。为此国际刑警组织的鲁邦三世专门搜查官钱形幸一警部与目暮警官为代表的日本警视厅密切合作，全力抓捕大盗。

他们在血泊中一步一步走来了！ 暗之拳斗集团“影道”为了达成他们悲壮的誓愿，想日本ジュニア递交了挑战状！ 为了救出被绑走的菊，冲入影道塔的龙儿将要面对的，是刺客们。 就这样开始的黄精的日本ジュニア与影道一族的最终决战，在那之中，出现了剑崎和与其一样身为影道总帅的另一人。 剑崎和总帅隐...